RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486016.1

GCFC2-209, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 3

Gene GCFC2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-209	ENST00000486016	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	MYO1C	O00159	1063 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	BTN3A1	O00481	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	SOCS2	O14508	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	INSIG1	O15503	277 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	AP1G1	O43747	822 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	PMPCB	O75439	489 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	FGB	P02675	491 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	CBSL	P0DN79	551 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	GK	P32189	559 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	CBS	P35520	551 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	KRT17	Q04695	432 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	TWIST1	Q15672	202 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	GPATCH3	Q96I76	525 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	BCAT1	P54687	386 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	SATB1	Q01826	763 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	MCL1	Q07820	350 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	MAML1	Q92585	1016 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	AIFM3	Q96NN9	605 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	MT-CO3	P00414	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	THBS4	P35443	961 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	LMAN2	Q12907	356 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	LRRC41	Q15345	812 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	SEC23B	Q15437	767 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	TAAR9	Q96RI9	348 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016		M0R3H8	397 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	ADAM10	O14672	748 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	SPRY2	O43597	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	PRF1	P14222	555 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	CCKBR	P32239	447 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	DIO1	P49895	249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	PRKAG1	P54619	331 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	CCNI	Q14094	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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