RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 PRR31Q5SQ13 230 aa6.73□□□□□ -1.33
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RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC8DQ7L1W4 858 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF605Q86T29 641 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 TTC30BQ8N4P2 665 aa6.73□□□□□ -1.33
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RABGGTB-209ENST00000473406 PWWP2AQ96N64 755 aa6.73□□□□□ -1.33
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RABGGTB-209ENST00000473406 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
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RABGGTB-209ENST00000473406 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 RILPL1Q5EBL4 403 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 NAA35Q5VZE5 725 aa6.72□□□□□ -1.33
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RABGGTB-209ENST00000473406 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.72□□□□□ -1.33
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RABGGTB-209ENST00000473406 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 PDCL3Q9H2J4 239 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
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RABGGTB-209ENST00000473406 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 TSPY2A6NKD2 308 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.71□□□□□ -1.34
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RABGGTB-209ENST00000473406 H3BNC9 293 aa6.71□□□□□ -1.34
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RABGGTB-209ENST00000473406 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.344e-37■■■□□ 18.2
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RABGGTB-209ENST00000473406 SAC3D1A6NKF1 404 aa6.7□□□□□ -1.34
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RABGGTB-209ENST00000473406 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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RABGGTB-209ENST00000473406 F9P00740 461 aa6.7□□□□□ -1.34
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RABGGTB-209ENST00000473406 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 ARL3P36405 182 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 CD97P48960 835 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 DGKEP52429 567 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 PRKAG1P54619 331 aa6.7□□□□□ -1.34
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