RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 C4orf50Q6ZRC1 276 aa11.96□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa11.96□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa11.96□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 CCDC65Q8IXS2 484 aa11.96□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 DEFB119Q8N690 84 aa11.96□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 OR6B3Q8NGW1 331 aa11.96□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 ZNF516Q92618 1163 aa11.96□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 ACDQ96AP0 544 aa11.96□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 DHX58Q96C10 678 aa11.96□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.49
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ACTB-209ENST00000473257 B3GNT5Q9BYG0 378 aa11.96□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 SNX25Q9H3E2 840 aa11.96□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 SMYD3Q9H7B4 428 aa11.96□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 EBF1Q9UH73 591 aa11.96□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa11.96□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
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ACTB-209ENST00000473257 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa11.95□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 SOBPA7XYQ1 873 aa11.95□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa11.95□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 TRIM24O15164 1050 aa11.95□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 TGFB1I1O43294 461 aa11.95□□□□□ -0.5
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ACTB-209ENST00000473257 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
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ACTB-209ENST00000473257 PGFP49763 221 aa11.95□□□□□ -0.5
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ACTB-209ENST00000473257 FOXC1Q12948 553 aa11.95□□□□□ -0.5
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ACTB-209ENST00000473257 UAP1L1Q3KQV9 507 aa11.95□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa11.95□□□□□ -0.5
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ACTB-209ENST00000473257 TMEFF1Q8IYR6 380 aa11.95□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 NAT16Q8N8M0 369 aa11.95□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 FSIP1Q8NA03 581 aa11.95□□□□□ -0.5
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ACTB-209ENST00000473257 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa11.95□□□□□ -0.5
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ACTB-209ENST00000473257 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
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ACTB-209ENST00000473257 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
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ACTB-209ENST00000473257 PTGER3P43115 390 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 MAPK8P45983 427 aa11.94□□□□□ -0.5
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ACTB-209ENST00000473257 ALCAMQ13740 583 aa11.94□□□□□ -0.5
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ACTB-209ENST00000473257 LY6G5CQ5SRR4 150 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 KIAA1211LQ6NV74 962 aa11.94□□□□□ -0.5
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ACTB-209ENST00000473257 CYP2U1Q7Z449 544 aa11.94□□□□□ -0.5
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ACTB-209ENST00000473257 WDR49Q8IV35 697 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 IL17RCQ8NAC3 791 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 HMGB4Q8WW32 186 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 FNBP1Q96RU3 617 aa11.94□□□□□ -0.5
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ACTB-209ENST00000473257 CCSER2Q9H7U1 834 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.57e-9■■■■■ 36.6
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ACTB-209ENST00000473257 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 MMP17Q9ULZ9 603 aa11.94□□□□□ -0.5
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