RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
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PRPF40A-208ENST00000472760 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
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PRPF40A-208ENST00000472760 SLC25A32Q9H2D1 315 aa5.72□□□□□ -1.49
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PRPF40A-208ENST00000472760 RMDN3Q96TC7 470 aa5.69□□□□□ -1.5
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PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF747Q9BV97 191 aa5.69□□□□□ -1.5
PRPF40A-208ENST00000472760 EHD3Q9NZN3 535 aa5.69□□□□□ -1.5
PRPF40A-208ENST00000472760 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PRPF40A-208ENST00000472760 ZAR1LA6NP61 321 aa5.68□□□□□ -1.5
PRPF40A-208ENST00000472760 ADM5C9JUS6 153 aa5.68□□□□□ -1.5
PRPF40A-208ENST00000472760 NPC1O15118 1278 aa5.68□□□□□ -1.5
PRPF40A-208ENST00000472760 MPPED1O15442 326 aa5.68□□□□□ -1.5
PRPF40A-208ENST00000472760 NARSO43776 548 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
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