RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467246.5

HPS1-208, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HPS1, Length 2,791 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-208ENST00000467246 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
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HPS1-208ENST00000467246 UNC45BQ8IWX7 931 aa11.97□□□□□ -0.49
HPS1-208ENST00000467246 C7orf31Q8N865 590 aa11.97□□□□□ -0.49
HPS1-208ENST00000467246 SLC35F5Q8WV83 523 aa11.97□□□□□ -0.49
HPS1-208ENST00000467246 CHMP6Q96FZ7 201 aa11.97□□□□□ -0.49
HPS1-208ENST00000467246 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
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HPS1-208ENST00000467246 ANKMY2Q8IV38 441 aa11.95□□□□□ -0.5
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HPS1-208ENST00000467246 YY1AP1Q9H869 796 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-208ENST00000467246 KCNK9Q9NPC2 374 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-208ENST00000467246 EURLQ9NYK6 297 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-208ENST00000467246 HESX1Q9UBX0 185 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-208ENST00000467246 LGALS13Q9UHV8 139 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-208ENST00000467246 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
HPS1-208ENST00000467246 KPNA7A9QM74 516 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-208ENST00000467246 ABHD2P08910 425 aa11.95□□□□□ -0.5
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