RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 BPIFB1Q8TDL5 484 aa21.74■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa21.74■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 DNASE1L2Q92874 299 aa21.74■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 SMOQ99835 787 aa21.74■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 NACA2Q9H009 215 aa21.74■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 TRPV5Q9NQA5 729 aa21.74■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 CHADO15335 359 aa21.73■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 PON1P27169 355 aa21.73■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 BPIFB4P59827 614 aa21.73■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 PRKCQQ04759 706 aa21.73■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 CNGA2Q16280 664 aa21.73■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.73■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 STXBP5Q5T5C0 1151 aa21.73■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 CDKAL1Q5VV42 579 aa21.73■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 TMEM150AQ86TG1 271 aa21.73■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 IL37Q9NZH6 218 aa21.73■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa21.73■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 MYO10Q9HD67 2058 aa21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 TNFRSF10BO14763 440 aa21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 NARSO43776 548 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 SETSIPP0DME0 302 aa21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 GLULP15104 373 aa21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 SLC9A1P19634 815 aa21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 ACO1P21399 889 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 FCARP24071 287 aa21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 GDI1P31150 447 aa21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 USP8P40818 1118 aa21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 ZNF165P49910 485 aa21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 TUBP50607 506 aa21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 CACNA2D1P54289 1103 aa21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 USP46P62068 366 aa21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 AMPD2Q01433 879 aa21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 BST2Q10589 180 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 HECTD3Q5T447 861 aa21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 ARHGEF19Q8IW93 802 aa21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 SIX5Q8N196 739 aa21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 EXOC4Q96A65 974 aa21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 MSANTD3Q96H12 275 aa21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 NELL2Q99435 816 aa21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 LRRC4Q9HBW1 653 aa21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 TSPAN16Q9UKR8 245 aa21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 SCML2Q9UQR0 700 aa21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 MUC3AQ02505 3323 aa21.72■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 MAN2B1O00754 1011 aa21.71■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 PTK2Q05397 1052 aa21.71■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 GOLGA8FQ08AF8 430 aa21.71■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa21.71■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 FCHO2Q0JRZ9 810 aa21.71■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 ARHGAP44Q17R89 818 aa21.71■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa21.71■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 FILIP1LQ4L180 1135 aa21.71■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 SLC44A4Q53GD3 710 aa21.71■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 SNX30Q5VWJ9 437 aa21.71■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 LCLAT1Q6UWP7 414 aa21.71■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 VITQ6UXI7 678 aa21.71■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 FBXL6Q8N531 539 aa21.71■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 UBR7Q8N806 425 aa21.71■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 KIAA1958Q8N8K9 716 aa21.71■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 SCAMP5Q8TAC9 235 aa21.71■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 ASIC4Q96FT7 647 aa21.71■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 LRFN3Q9BTN0 628 aa21.71■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 VPS16Q9H269 839 aa21.71■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 ARHGEF3Q9NR81 526 aa21.71■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 TAB2Q9NYJ8 693 aa21.71■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 CNTN6Q9UQ52 1028 aa21.71■■□□□ 1.07
IMP4-209ENST00000462357 FAM92AA1XBS5 289 aa21.7■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 FAM86C2PA6NEL3 165 aa21.7■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 BEST1O76090 585 aa21.7■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 RALAP11233 206 aa21.7■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 SNX16P57768 344 aa21.7■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 GRM2Q14416 872 aa21.7■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 KRT31Q15323 416 aa21.7■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 MIIPQ5JXC2 388 aa21.7■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 ZMIZ2Q8NF64 920 aa21.7■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 PRRX2Q99811 253 aa21.7■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa21.7■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 DNAJC12Q9UKB3 198 aa21.7■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa21.7■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 DOCK6Q96HP0 2047 aa21.7■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 DOCK8Q8NF50 2099 aa21.69■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 SYCE3A1L190 88 aa21.69■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 LRRC10BA6NIK2 292 aa21.69■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 NCAM2O15394 837 aa21.69■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 CLCN5P51795 746 aa21.69■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 KIF11P52732 1056 aa21.69■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 PDGFRLQ15198 375 aa21.69■■□□□ 1.06
IMP4-209ENST00000462357 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms