RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460759.1

NISCH-203, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-203ENST00000460759 IRGQQ8WZA9 623 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-203ENST00000460759 RUBCNQ92622 972 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-203ENST00000460759 ALG3Q92685 438 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-203ENST00000460759 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
NISCH-203ENST00000460759 ZNF558Q96NG5 402 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-203ENST00000460759 LPIN3Q9BQK8 851 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-203ENST00000460759 HTATIP2Q9BUP3 242 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-203ENST00000460759 CWH43Q9H720 699 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-203ENST00000460759 AAASQ9NRG9 546 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-203ENST00000460759 TMEM51Q9NW97 253 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-203ENST00000460759 TJP2Q9UDY2 1190 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-203ENST00000460759 VWA8A3KMH1 1905 aa13.52□□□□□ -0.24
NISCH-203ENST00000460759 F8W810 466 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 TULP2O00295 520 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 CLDN5O00501 218 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 DAB1O75553 588 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 PDGFRAP16234 1089 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 PPM1AP35813 382 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 MAGEA11P43364 429 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 PTPN9P43378 593 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 MAP3K7CLP57077 242 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 COPS2P61201 443 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 ADIGQ0VDE8 80 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 PTPROQ16827 1216 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 USP41Q3LFD5 358 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 CTXN3Q4LDR2 81 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 ODF2Q5BJF6 829 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 TEX35Q5T0J7 233 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 GPR65Q8IYL9 337 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 JOSD2Q8TAC2 188 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 KRT35Q92764 455 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 CEP295NLQ96MC4 621 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 SMOQ99835 787 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 TTPALQ9BTX7 342 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 RRN3Q9NYV6 651 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 MTUS1Q9ULD2 1270 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 TRIM66O15016 1216 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 GJB6O95452 261 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 EFEMP2O95967 443 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 FGBP02675 491 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 LCP1P13796 627 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 MCM3P25205 808 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 SSR1P43307 286 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 DEFB103AP81534 67 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 OGDHQ02218 1023 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 LONRF2Q1L5Z9 754 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 DCAF12L1Q5VU92 463 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 KCNT2Q6UVM3 1135 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 SCUBE3Q8IX30 993 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 RCOR2Q8IZ40 523 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 SPPL2BQ8TCT7 592 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 RXFP2Q8WXD0 754 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 DPF3Q92784 378 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 TMEM169Q96HH4 297 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 IGSF21Q96ID5 467 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 MS4A14Q96JA4 679 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 RUNDC3BQ96NL0 473 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 YME1L1Q96TA2 773 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 TBCBQ99426 244 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 GPR62Q9BZJ7 368 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 STAP1Q9ULZ2 295 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 USTQ9Y2C2 406 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 BACE2Q9Y5Z0 518 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 SPDYE4A6NLX3 237 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 F8VP50 259 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 H0YGN5 161 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 KRIT1O00522 736 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 LRCH4O75427 683 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 FGGP02679 453 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 BDNFP23560 247 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 PTPN7P35236 360 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 MATKP42679 507 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 MARCKSL1P49006 195 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 TKTL1P51854 596 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 ADCY1Q08828 1119 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 GPR17Q13304 367 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 SLC39A12Q504Y0 691 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 BEND5Q7L4P6 421 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 STRADAQ7RTN6 431 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 CEP57Q86XR8 500 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 SLC39A11Q8N1S5 342 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 EMC1Q8N766 993 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 ZMIZ2Q8NF64 920 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 PIK3R5Q8WYR1 880 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 C8orf48Q96LL4 319 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 SLC9A7Q96T83 725 aa13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms