RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 HLA-DRAP01903 254 aa20.78■□□□□ 0.92
NPAS1-201ENST00000439365 TRIM49P0CI25 452 aa20.78■□□□□ 0.92
NPAS1-201ENST00000439365 TRIM49CP0CI26 452 aa20.78■□□□□ 0.92
NPAS1-201ENST00000439365 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
NPAS1-201ENST00000439365 GALK1P51570 392 aa20.78■□□□□ 0.92
NPAS1-201ENST00000439365 ADAM9Q13443 819 aa20.78■□□□□ 0.92
NPAS1-201ENST00000439365 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
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NPAS1-201ENST00000439365 ATG13O75143 517 aa20.78■□□□□ 0.92
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NPAS1-201ENST00000439365 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
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NPAS1-201ENST00000439365 CFAP97Q9P2B7 532 aa20.75■□□□□ 0.91
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NPAS1-201ENST00000439365 NUCB2P80303 420 aa20.74■□□□□ 0.91
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NPAS1-201ENST00000439365 LAIR1Q6GTX8 287 aa20.74■□□□□ 0.91
NPAS1-201ENST00000439365 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
NPAS1-201ENST00000439365 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa20.74■□□□□ 0.91
NPAS1-201ENST00000439365 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.74■□□□□ 0.91
NPAS1-201ENST00000439365 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.74■□□□□ 0.91
NPAS1-201ENST00000439365 SPTBN4Q9H254 2564 aa20.74■□□□□ 0.91
NPAS1-201ENST00000439365 GREB1Q4ZG55 1949 aa20.73■□□□□ 0.91
NPAS1-201ENST00000439365 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
NPAS1-201ENST00000439365 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP20.73■□□□□ 0.91
NPAS1-201ENST00000439365 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.73■□□□□ 0.91
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