RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436881.2

C9orf172-201, Transcript of Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene C9orf172, Length 4,387 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF286BP0CG31 522 aa16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 THPOP40225 353 aa16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 NDST1P52848 882 aa16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 BST2Q10589 180 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 SNX17Q15036 470 aa16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 SLFN11Q7Z7L1 901 aa16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 YIPF3Q9GZM5 350 aa16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 RRAGCQ9HB90 399 aa16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 SLC24A2Q9UI40 661 aa16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 TSPAN16Q9UKR8 245 aa16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 AP4E1Q9UPM8 1137 aa16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 L3MBTL1Q9Y468 752 aa16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 SLC2A3P11169 496 aa16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 RTP1P59025 263 aa16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 SATB1Q01826 763 aa16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 KDSRQ06136 332 aa16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 MGAT5BQ3V5L5 792 aa16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 SLC27A1Q6PCB7 646 aa16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 LINC00523Q86TU6 105 aa16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 FAM131BQ86XD5 332 aa16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 IPMKQ8NFU5 416 aa16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 LMCD1Q9NZU5 365 aa16.69■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 TRPA1O75762 1119 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 ANXA9O76027 345 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 FBXO21O94952 628 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 HMBSP08397 361 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 ADRB2P07550 413 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 GLRA2P23416 452 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 ADORA2AP29274 412 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 AP1ARQ63HQ0 302 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 TASP1Q9H6P5 420 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 ADA2Q9NZK5 511 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 GFAPP14136 432 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 LHX1P48742 406 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 RAD23BP54727 409 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 HIC1Q14526 733 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 DNAL1Q4LDG9 190 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 TAS2R42Q7RTR8 314 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 KPNA6O60684 536 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF410Q86VK4 478 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 ARHGAP18Q8N392 663 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 ELMO3Q96BJ8 720 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 KDM4CQ9H3R0 1056 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 SNTG2Q9NY99 539 aa16.68■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 CASZ1Q86V15 1759 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 ZBBXA8MT70 800 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 RPL21P46778 160 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 MFSD7Q6UXD7 560 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 CHSY1Q86X52 802 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 C12orf56Q8IXR9 622 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 CDC26Q8NHZ8 85 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 EGFL8Q99944 293 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 CPA4Q9UI42 421 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 ADAMTSL3P82987 1691 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 ENO1P06733 434 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 ACAP1Q15027 740 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 TRIM54Q9BYV2 358 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 PLIN4Q96Q06 1357 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 SDR42E2A6NKP2 422 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 HMGCRP04035 888 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 CDH8P55286 799 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 IL1RL1Q01638 556 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 DNAJC18Q9H819 358 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 FZD1Q9UP38 647 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 KLHL2O95198 593 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 CUL3Q13618 768 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 TMEM132BQ14DG7 1078 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 ZACNQ401N2 412 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 RABGAP1LQ5R372 815 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 ARMC2Q8NEN0 867 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 MRGBPQ9NV56 204 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 TAS2R14Q9NYV8 317 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 GRIN2DO15399 1336 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 LACTBL1A8MY62 500 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 RIPK2O43353 540 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 PDHA1P08559 390 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 IMPG1Q17R60 797 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf172-201ENST00000436881 ACCSLQ4AC99 568 aa16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms