RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 NBPF26B4DH59 902 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 EPB42P16452 691 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP11.39□□□□□ -0.595e-7■■■■□ 26.7
EFTUD2-202ENST00000426333 MTMR2Q13614 643 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 RINLQ6ZS11 566 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 NBPF15Q8N660 670 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ENGASEQ8NFI3 743 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC126Q96EE4 140 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SLITRK1Q96PX8 696 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 KCTD10Q9H3F6 313 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKEF1Q9NU02 776 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CRLS1Q9UJA2 301 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF609O15014 1411 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 TIMM44O43615 452 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 EXTL3O43909 919 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CTSHP09668 335 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 NCAM1P13591 858 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 PRLRP16471 622 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 FDFT1P37268 417 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ACAD10Q6JQN1 1059 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 GLB1LQ6UWU2 654 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 RSPH1Q8WYR4 309 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATA16Q9BXB7 569 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 VCPKMTQ9H867 229 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 H0YC42 278 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 DLGAP3O95886 979 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ANTXR2P58335 489 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 NCALDP61601 193 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ITIH4Q14624 930 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SV2CQ496J9 727 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 IER5Q5VY09 327 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 HPDLQ96IR7 371 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 BRD2P25440 801 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 MMRN1Q13201 1228 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SCUBE1Q8IWY4 988 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 YAF2Q8IY57 180 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 DDIT4Q9NX09 232 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 WWOXQ9NZC7 414 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 VWA5AO00534 786 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CYTH3O43739 400 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP11B2P19099 503 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 PEX5P50542 639 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC16A1P53985 500 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 NCKAP1LP55160 1127 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 NFIXQ14938 502 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SNX17Q15036 470 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGAP17Q68EM7 881 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC8DQ7L1W4 858 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 STKLD1Q8NE28 680 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ATG4AQ8WYN0 398 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 MXRA8Q9BRK3 442 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 EPS8L2Q9H6S3 715 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM200BP0CF97 657 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 PYGMP11217 842 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 RASA1P20936 1047 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 MUTP22033 750 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SCTRP47872 440 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 GJB7Q6PEY0 223 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 C17orf75Q9HAS0 396 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SNTNA6NMZ2 147 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 O00370 1275 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ENTPD3O75355 529 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CLPTM1O96005 669 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 RAD23AP54725 363 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 PLIN5Q00G26 463 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 LAMC2Q13753 1193 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP4A22Q5TCH4 519 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CACHD1Q5VU97 1274 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF280CQ8ND82 737 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SYTL2Q9HCH5 934 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 DCDC2Q9UHG0 476 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 C19orf81C9J6K1 198 aa11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms