RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425660.5

ACTB-204, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-204ENST00000425660 HASPINQ8TF76 798 aa15.95■□□□□ 0.14
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ACTB-204ENST00000425660 HINFPQ9BQA5 517 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 UBXN6Q9BZV1 441 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 HOMER3Q9NSC5 361 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 PCDHB8Q9UN66 801 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 EFR3BQ9Y2G0 817 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 SASH3O75995 380 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 KRT1P04264 644 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 CDKN2BP42772 138 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 PTPN9P43378 593 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 ADCY1Q08828 1119 aa15.94■□□□□ 0.14
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ACTB-204ENST00000425660 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
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ACTB-204ENST00000425660 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
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ACTB-204ENST00000425660 CASD1Q96PB1 797 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 NCAPGQ9BPX3 1015 aa15.94■□□□□ 0.14
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ACTB-204ENST00000425660 FAM53CQ9NYF3 392 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 TBX21Q9UL17 535 aa15.94■□□□□ 0.14
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ACTB-204ENST00000425660 TFDP3Q5H9I0 405 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 RAB41Q5JT25 222 aa15.94■□□□□ 0.14
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ACTB-204ENST00000425660 MFSD7Q6UXD7 560 aa15.94■□□□□ 0.14
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ACTB-204ENST00000425660 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 ABI1Q8IZP0 508 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 OR10T2Q8NGX3 314 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 CLEC4CQ8WTT0 213 aa15.94■□□□□ 0.14
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ACTB-204ENST00000425660 SCLYQ96I15 445 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 CFAP57Q96MR6 1250 aa15.94■□□□□ 0.14
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ACTB-204ENST00000425660 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa15.93■□□□□ 0.14
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ACTB-204ENST00000425660 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
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ACTB-204ENST00000425660 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa15.93■□□□□ 0.14
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ACTB-204ENST00000425660 ZMIZ2Q8NF64 920 aa15.93■□□□□ 0.14
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ACTB-204ENST00000425660 MED10Q9BTT4 135 aa15.93■□□□□ 0.14
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ACTB-204ENST00000425660 TRAPPC3O43617 180 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 HSF2BPO75031 334 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 AP1G2O75843 785 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 ENDOD1O94919 500 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 TJP3O95049 919 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 DESP17661 470 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 CCL23P55773 120 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 MAP3K7CLP57077 242 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 ADIGQ0VDE8 80 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 LLGL1Q15334 1064 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 KCNT1Q5JUK3 1230 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 DUPD1Q68J44 220 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 NPAS4Q8IUM7 802 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-204ENST00000425660 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
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