RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM213AQ9BRX8 229 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 UGT1A7Q9HAW7 530 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 UGT1A10Q9HAW8 530 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 UGT1A8Q9HAW9 530 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CISHQ9NSE2 258 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1B0GTW7 788 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ASNSP08243 561 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 EZRP15311 586 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ACTR2P61160 394 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FAAP100Q0VG06 881 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PALM2Q8IXS6 379 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBED8Q8IZ13 594 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXO36Q8NEA4 188 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MCPH1Q8NEM0 835 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM134Q9H6X4 195 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SAYSD1Q9NPB0 183 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CHD9Q3L8U1 2897 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TM9SF1O15321 606 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 METTL18O95568 372 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ATF2P15336 505 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 STX2P32856 288 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ACOT2P49753 483 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 OAZ1P54368 228 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MTM1Q13496 603 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CA9Q16790 459 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PASD1Q8IV76 773 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MGARPQ8TDB4 240 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM11Q96F44 468 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 BTBD10Q9BSF8 475 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MAF1Q9H063 256 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 DPYSL4O14531 572 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SPAG7O75391 227 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TOM1L1O75674 476 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP5HO75947 161 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 STAU1O95793 577 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GMPRP36959 345 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ADCY8P40145 1251 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ARL4CP56559 192 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 DPYSL3Q14195 570 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MSL1Q68DK7 614 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 DENND1BQ6P3S1 775 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 LVRNQ6Q4G3 990 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM270Q6UE05 265 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RCOR2Q8IZ40 523 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RMDN3Q96TC7 470 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TXLNGQ9NUQ3 528 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 KBTBD13C9JR72 458 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 NFKBIEO00221 500 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZWINTO95229 277 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ARIH2O95376 493 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FYNP06241 537 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RPSAP08865 295 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ALDH1B1P30837 517 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC62Q6P9F0 684 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC174Q6PII3 467 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 UNC5BQ8IZJ1 945 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 BBOF1Q8ND07 529 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SPDL1Q96EA4 605 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MMP19Q99542 508 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC4A5Q9BY07 1137 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 NEU3Q9UQ49 428 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MIPP30301 263 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAF1Q13077 416 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 EMC2Q15006 297 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ODF2Q5BJF6 829 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC25Q86WR0 208 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GPATCH11Q8N954 259 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 AGBL3Q8NEM8 1001 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ACVR1CQ8NER5 493 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR78Q96P69 363 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 NIF3L1Q9GZT8 377 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 IFT122Q9HBG6 1241 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM30AQ9NV96 361 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GABBR1Q9UBS5 961 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SCINQ9Y6U3 715 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms