RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413164.6

SLC13A3-204, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SLC13A3, Length 2,008 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-204ENST00000413164 GDF10P55107 478 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 SP3Q02447 781 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 RAB6CQ53S08 254 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 ARHGAP17Q68EM7 881 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 STK32AQ8WU08 396 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 HSPH1Q92598 858 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 RAB6CQ9H0N0 254 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 CCDC134Q9H6E4 229 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 Q9Y3F1 56 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 CYP2B6P20813 491 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 CTGFP29279 349 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 HOXC8P31273 242 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 RGS7P49802 495 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 STAT4Q14765 748 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 CCDC38Q502W7 563 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 UBXN11Q5T124 520 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 FAM49BQ9NUQ9 324 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 IFNB1P01574 187 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 KCNE1P15382 129 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 ATP5DP30049 168 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 QPCTQ16769 361 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 CCDC14Q49A88 953 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 SOCS4Q8WXH5 440 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 TSPAN18Q96SJ8 248 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 ANKRD65E5RJM6 399 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 CD4P01730 458 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 RGS2P41220 211 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 SLC6A3Q01959 620 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 FBXO47Q5MNV8 452 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 LIMS2Q7Z4I7 341 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 RFX6Q8HWS3 928 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 CHMP6Q96FZ7 201 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 CFHR5Q9BXR6 569 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 CALN1Q9BXU9 219 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 SAYSD1Q9NPB0 183 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 RNF19AQ9NV58 838 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 GDAP2Q9NXN4 497 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 ALOX15BO15296 676 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 CDH16O75309 829 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 GRAP2O75791 330 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 DRD4P21917 467 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 PDE4CQ08493 712 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 PCGF5Q86SE9 256 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 CRYBG2Q8N1P7 616 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 OR6B3Q8NGW1 331 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 CFAP57Q96MR6 1250 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 TTC25Q96NG3 672 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 PHACTR1Q9C0D0 580 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 DPEP3Q9H4B8 488 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 C10orf88Q9H8K7 445 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 TRIM66O15016 1216 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 SPTLC1O15269 473 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 BEX3Q00994 111 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 DPYSL3Q14195 570 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 C6orf89Q6UWU4 347 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 VSTM1Q6UX27 236 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 SESTD1Q86VW0 696 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 APOL6Q9BWW8 343 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 RNF39Q9H2S5 420 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 HESX1Q9UBX0 185 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 KPNA7A9QM74 516 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 MYL3P08590 195 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 RPL22P35268 128 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 RPL34P49207 117 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 CDH6P55285 790 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 C1QTNF8P60827 252 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 MMRN1Q13201 1228 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 UNC45BQ8IWX7 931 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 SCUBE3Q8IX30 993 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 CYP4X1Q8N118 509 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 CPT1BQ92523 772 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 CCDC77Q9BR77 488 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 A8MXQ7 604 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 HCRTO43612 131 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 PRPSAP2O60256 369 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 FGFR1P11362 822 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 CREB1P16220 341 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms