RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
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CCL20-202ENST00000409189 NKX3-2P78367 333 aa7.18□□□□□ -1.26
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CCL20-202ENST00000409189 UNC13DQ70J99 1090 aa7.18□□□□□ -1.26
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CCL20-202ENST00000409189 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa7.18□□□□□ -1.26
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CCL20-202ENST00000409189 CDC25AP30304 524 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL20-202ENST00000409189 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
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CCL20-202ENST00000409189 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.17□□□□□ -1.26
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CCL20-202ENST00000409189 RIOX2Q8IUF8 465 aa7.16□□□□□ -1.26
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CCL20-202ENST00000409189 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
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CCL20-202ENST00000409189 TEKT3Q9BXF9 490 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL20-202ENST00000409189 THAP9Q9H5L6 903 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL20-202ENST00000409189 ACAD9Q9H845 621 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL20-202ENST00000409189 SPC25Q9HBM1 224 aa7.16□□□□□ -1.26
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