RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 MAN1A1P33908 653 aa21.53■■□□□ 1.04
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ATG4B-204ENST00000402096 PSMD5Q16401 504 aa21.53■■□□□ 1.04
ATG4B-204ENST00000402096 CEP112Q8N8E3 955 aa21.53■■□□□ 1.04
ATG4B-204ENST00000402096 KRT35Q92764 455 aa21.53■■□□□ 1.04
ATG4B-204ENST00000402096 CD101Q93033 1021 aa21.53■■□□□ 1.04
ATG4B-204ENST00000402096 PBKQ96KB5 322 aa21.53■■□□□ 1.04
ATG4B-204ENST00000402096 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
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ATG4B-204ENST00000402096 CDY1Q9Y6F8 540 aa21.53■■□□□ 1.04
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC66A2RUB6 948 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-204ENST00000402096 F8VP50 259 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-204ENST00000402096 CEP104O60308 925 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-204ENST00000402096 EFEMP2O95967 443 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-204ENST00000402096 PDGFRAP16234 1089 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-204ENST00000402096 CTNNA2P26232 953 aa21.52■■□□□ 1.04
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ATG4B-204ENST00000402096 PPM1AP35813 382 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-204ENST00000402096 GJC1P36383 396 aa21.52■■□□□ 1.04
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ATG4B-204ENST00000402096 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-204ENST00000402096 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-204ENST00000402096 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-204ENST00000402096 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-204ENST00000402096 FNIP1Q8TF40 1166 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-204ENST00000402096 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-204ENST00000402096 RXFP2Q8WXD0 754 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-204ENST00000402096 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM59LQ9UK28 342 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-204ENST00000402096 MYO16Q9Y6X6 1858 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-204ENST00000402096 TLL1O43897 1013 aa21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 FLT3P36888 993 aa21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 PAFAH1B1P43034 410 aa21.51■■□□□ 1.03
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ATG4B-204ENST00000402096 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 EFHC1Q5JVL4 640 aa21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 CREG2Q8IUH2 290 aa21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 PIK3R5Q8WYR1 880 aa21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 FAM149B1Q96BN6 582 aa21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 MS4A14Q96JA4 679 aa21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 ULBP1Q9BZM6 244 aa21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 EHD2Q9NZN4 543 aa21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 C2CD4BA6NLJ0 364 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 HHLA1C9JL84 531 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 TBC1D4O60343 1298 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 FBXO21O94952 628 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 RPL17P18621 184 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
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ATG4B-204ENST00000402096 SLC26A9Q7LBE3 791 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
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ATG4B-204ENST00000402096 NIPA2Q8N8Q9 360 aa21.5■■□□□ 1.03
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ATG4B-204ENST00000402096 FBXO22Q8NEZ5 403 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 ALG3Q92685 438 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 RAD9AQ99638 391 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 CHST7Q9NS84 486 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 ASNSD1Q9NWL6 643 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 MTRRQ9UBK8 725 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 CTAGE15A4D2H0 777 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 CES2O00748 559 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 RNF8O76064 485 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 URODP06132 367 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 USP17L7P0C7H9 530 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 CTAGE8P0CG41 777 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 DESP17661 470 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 SDC4P31431 198 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 RWDD2BP57060 319 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 TAS2R40P59535 323 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 KRT17Q04695 432 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 ADCY1Q08828 1119 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 GPR17Q13304 367 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 RAB41Q5JT25 222 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 TRNP1Q6NT89 227 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 CTAGE6Q86UF2 777 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 CTAGE4Q8IX94 777 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 LRRN4CLQ8ND94 238 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 MYRIPQ8NFW9 859 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.033e-7■■□□□ 12.3
ATG4B-204ENST00000402096 CFAP57Q96MR6 1250 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 MTMR11A4FU01 709 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 HSF2BPO75031 334 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 PEX5P50542 639 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 CDO1Q16878 200 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 DCAF12L1Q5VU92 463 aa21.49■■□□□ 1.03
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