RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPR158Q5T848 1215 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GJB7Q6PEY0 223 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MON1AQ86VX9 555 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBALD2Q8IYN6 164 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ELSPBP1Q96BH3 223 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STK33Q9BYT3 514 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OBP2AQ9NY56 170 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SIK3Q9Y2K2 1263 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1B0GTH6 734 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HHLA1C9JL84 531 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DCXO43602 365 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TADA3O75528 432 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SERPINC1P01008 464 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GJA1P17302 382 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLXNA3P51805 1871 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP46P62068 366 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 APBA1Q02410 837 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAF10Q12962 218 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYCP1Q15431 976 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PKDCCQ504Y2 493 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM78AQ5JUQ0 283 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNX30Q5VWJ9 437 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TTC30AQ86WT1 665 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM71AQ8IYT1 594 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STKLD1Q8NE28 680 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TFAP2BQ92481 460 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FBXO32Q969P5 355 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GANQ9H2C0 597 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZFP14Q9HCL3 533 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FHOD1Q9Y613 1164 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP3Q9Y6I4 520 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUMBLQ9Y6R0 609 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VCANP13611 3396 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1W2PQC6 194 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF840PA6NDX5 716 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GNA15P30679 374 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AVPR1AP37288 418 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP8P40818 1118 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLA2G4AP47712 749 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TUBP50607 506 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIF11P52732 1056 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYP4F8P98187 520 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAPGEF1Q13905 1077 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAB41Q5JT25 222 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PARM1Q6UWI2 310 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PIGZQ86VD9 579 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FMNL3Q8IVF7 1028 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CMTM8Q8IZV2 173 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NEK11Q8NG66 645 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCTD13Q8WZ19 329 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZSWIM3Q96MP5 696 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC46A2Q9BY10 475 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIF9Q9HAQ2 790 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MUTYHQ9UIF7 546 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCML2Q9UQR0 700 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 F8VZ95 297 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PI4K2BG5E9Z4 385 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ASGR2P07307 311 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FCARP24071 287 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BRD2P25440 801 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDE4CQ08493 712 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC186Q7Z3E2 898 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARHGAP18Q8N392 663 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC44A3Q8N4M1 653 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCAMP5Q8TAC9 235 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STK32AQ8WU08 396 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC35F5Q8WV83 523 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF606Q8WXB4 792 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FGF14Q92915 247 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HSFY1Q96LI6 401 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZSWIM1Q9BR11 485 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCDHGC3Q9UN70 934 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DUSP12Q9UNI6 340 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A0C4DFX4 3053 aa16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 M0QYV0 167 aa16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DLL1O00548 723 aa16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DPYSL4O14531 572 aa16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYP26A1O43174 497 aa16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 THAP12O43422 761 aa16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OLFM2O95897 454 aa16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TPM3P06753 285 aa16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP17L7P0C7H9 530 aa16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SRFP11831 508 aa16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FANCCQ00597 558 aa16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STXBP5Q5T5C0 1151 aa16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms