RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376233.7

ZNF549-202, Transcript of zinc finger protein 549, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF549, Length 4,053 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549-202ENST00000376233 LRRC6Q86X45 466 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 REPS2Q8NFH8 660 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 AGAP11Q8TF27 550 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 AAASQ9NRG9 546 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 LRCH4O75427 683 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 ATP5HO75947 161 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 ZWINTO95229 277 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 KRT16P08779 473 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 TGFB3P10600 412 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 ATP4AP20648 1035 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 GDF10P55107 478 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 OGDHQ02218 1023 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 FAAP100Q0VG06 881 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 MTFR1Q15390 333 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 SLC1A5Q15758 541 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 NXNQ6DKJ4 435 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 FAM131BQ86XD5 332 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 SCYL1Q96KG9 808 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 CNPY3Q9BT09 278 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 PAK5Q9P286 719 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 KAT6AQ92794 2004 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 SIGLEC16A6NMB1 481 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 VDRP11473 427 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 ACO1P21399 889 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 NCALDP61601 193 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 MPP2Q14168 576 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 C6orf89Q6UWU4 347 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 PID1Q7Z2X4 250 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 ASB14A6NK59 587 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 PMM2O15305 246 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 GRIN3BO60391 1043 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 HUS1O60921 280 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 HMGCRP04035 888 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 RARBP10826 455 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 TAC1P20366 129 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 RBL1P28749 1068 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 STIP1P31948 543 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 DCAF6Q58WW2 860 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 ATG16L1Q676U5 607 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 NRAPQ86VF7 1730 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 SOWAHBA6NEL2 793 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 C5orf60A6NFR6 353 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 SLC25A27O95847 323 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 ERBB2P04626 1255 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 EPHB2P29323 1055 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 FOXN2P32314 431 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 CDKN2BP42772 138 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 EPHB1P54762 984 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 DPYSL3Q14195 570 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 PGBD4Q96DM1 585 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 PPP1R36Q96LQ0 422 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 TMEM109Q9BVC6 243 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 HAPLN2Q9GZV7 340 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 SLC24A2Q9UI40 661 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 ATP9BO43861 1147 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 CHI3L2Q15782 390 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 PIGWQ7Z7B1 504 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 TTC1Q99614 292 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 IFT122Q9HBG6 1241 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 CYP4F11Q9HBI6 524 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 SNTG2Q9NY99 539 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 ARMCX1Q9P291 453 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 HMGXB4Q9UGU5 601 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 FIS1Q9Y3D6 152 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 AKAP5P24588 427 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 FNBP1LQ5T0N5 605 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 SCARA3Q6AZY7 606 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 ECHDC2Q86YB7 292 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 TRIM42Q8IWZ5 723 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 CAMKK2Q96RR4 588 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 VPS33BQ9H267 617 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 GPRC5DQ9NZD1 345 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 SLC17A7Q9P2U7 560 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 GPR25O00155 361 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 GAS2O43903 313 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 CCND1P24385 295 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 WDR4P57081 412 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 BOLA3Q53S33 107 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 LBX2Q6XYB7 198 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF549-202ENST00000376233 RIOX2Q8IUF8 465 aa11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms