RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 ANKRD22Q5VYY1 191 aa13.79□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 PPIL6Q8IXY8 311 aa13.79□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 KCTD6Q8NC69 237 aa13.79□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 NRG4Q8WWG1 115 aa13.79□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 NLRP4Q96MN2 994 aa13.79□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 LRCH1Q9Y2L9 728 aa13.79□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 MED7O43513 233 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 HOXC6P09630 235 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 KRT4P19013 534 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 VHLP40337 213 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 CACNA2D1P54289 1103 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 USP4Q13107 963 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP13.78□□□□□ -0.22e-6■■■■□ 23.6
TMOD1-202ENST00000375175 FNBP1LQ5T0N5 605 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 TREML2Q5T2D2 321 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 POLNQ7Z5Q5 900 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 RFX6Q8HWS3 928 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 CCNJLQ8IV13 435 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 TTC13Q8NBP0 860 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 OCEL1Q9H607 264 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 DCLRE1BQ9H816 532 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 BTBD7Q9P203 1132 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 CYTH4Q9UIA0 394 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 GRID1Q9ULK0 1009 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 LCTP09848 1927 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 NOP56O00567 594 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 GJB1P08034 283 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 CD48P09326 243 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 RPL22P35268 128 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC6Q16204 474 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 PDK4Q16654 411 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC142Q17RM4 750 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 BBS9Q3SYG4 887 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 MSS51Q4VC12 460 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 ATF7IP2Q5U623 682 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 LVRNQ6Q4G3 990 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 MPZL3Q6UWV2 235 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 PALM2Q8IXS6 379 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 CPT1BQ92523 772 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 HSPH1Q92598 858 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 FAM167AQ96KS9 214 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 XYLT2Q9H1B5 865 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 RABGEF1Q9UJ41 708 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 USH1CQ9Y6N9 552 aa13.78□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa13.77□□□□□ -0.2
TMOD1-202ENST00000375175 WDR91A4D1P6 747 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 MAGEB2O15479 319 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 B4GALT5O43286 388 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 MOGSQ13724 837 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 RCN1Q15293 331 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF667Q5HYK9 610 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 METTL7BQ6UX53 244 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 DPH6Q7L8W6 267 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 DEFB132Q7Z7B7 95 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 UNC45BQ8IWX7 931 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 ATP11CQ8NB49 1132 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 CPXM1Q96SM3 734 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 CALN1Q9BXU9 219 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 MAF1Q9H063 256 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 GGA3Q9NZ52 723 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 STOML1Q9UBI4 398 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 CLUHO75153 1309 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 ZBTB7AO95365 584 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 SERPINB4P48594 390 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 SNX30Q5VWJ9 437 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 LBX2Q6XYB7 198 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 BBS12Q6ZW61 710 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM130Q8N3G9 435 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 FAM71DQ8N9W8 422 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 FBXO36Q8NEA4 188 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 TRPM4Q8TD43 1214 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 MIPEPQ99797 713 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 C2orf40Q9H1Z8 148 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 PPCSQ9HAB8 311 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa13.77□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa13.76□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 GOLGA8RI6L899 631 aa13.76□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 EDF1O60869 148 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 KRT36O76013 467 aa13.76□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 CXCL8P10145 99 aa13.76□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 SLC18A1P54219 525 aa13.76□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 BASP1P80723 227 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 TAF5Q15542 800 aa13.76□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 HSDL1Q3SXM5 330 aa13.76□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 EFHC2Q5JST6 749 aa13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms