RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368147.8

SPTA1-201, Transcript of spectrin alpha, erythrocytic 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTA1, Length 7,999 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Dendrite .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1-201ENST00000368147 ABCA6Q8N139 1617 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 NFIBO00712 420 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 NUDT14O95848 222 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 FDX1P10109 184 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 HSD3B2P26439 372 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 ADCYAP1R1P41586 468 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 HIC1Q14526 733 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 GALNTL6Q49A17 601 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 TTC13Q8NBP0 860 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 AGBL3Q8NEM8 1001 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 RERGLQ9H628 205 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 ABHD10Q9NUJ1 306 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 KLHL20Q9Y2M5 609 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 TBC1D3BA6NDS4 549 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 FKTNO75072 461 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 SCRN3Q0VDG4 424 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 ZMYND11Q15326 602 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 GRIK4Q16099 956 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 SLC25A24Q6NUK1 477 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 RHOT1Q8IXI2 618 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 SIRT2Q8IXJ6 389 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 FAM45AQ8TCE6 357 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 MCRS1Q96EZ8 462 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 CENPXA8MT69 81 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 ECDO95905 644 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 HLA-DRAP01903 254 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 ARHGDIBP52566 201 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 P3H1Q32P28 736 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 FBXO42Q6P3S6 717 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 NAT16Q8N8M0 369 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 FAM162AQ96A26 154 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 FAM129AQ9BZQ8 928 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 FAM192AQ9GZU8 254 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 LZTS1Q9Y250 596 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 GYG2O15488 501 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 CHP2O43745 196 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.242e-7■■■■■ 42.6
SPTA1-201ENST00000368147 IL10P22301 178 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 CASP4P49662 377 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 C21orf59P57076 290 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 C6orf10Q5SRN2 563 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 FAXCQ5TGI0 409 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 IZUMO3Q5VZ72 239 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 HHIPL2Q6UWX4 724 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 BARGINQ6ZT62 677 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 PXMP2Q9NR77 195 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 UBP1Q9NZI7 540 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 A0A087WZ62 844 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 HEATR9A2RTY3 570 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 ATP8B1O43520 1251 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 EXTL3O43909 919 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 PEX1O43933 1283 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 RTN2O75298 545 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 KRT38O76015 456 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 IL1R1P14778 569 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF445P59923 1031 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 IKBKEQ14164 716 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 NECTIN1Q15223 517 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 ARHGAP17Q68EM7 881 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 PITPNM3Q9BZ71 974 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 JMJD4Q9H9V9 463 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 WWOXQ9NZC7 414 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 STOML2Q9UJZ1 356 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 A0A1W2PRG6 482 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 MEI4A8MW99 385 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 FKBP9O95302 570 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 RFC5P40937 340 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 SPARCL1Q14515 664 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 TAB1Q15750 504 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 FKBP9P1Q75LS8 142 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 COMMD2Q86X83 199 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 EXD1Q8NHP7 514 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 SLC35G2Q8TBE7 412 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 MAML3Q96JK9 1138 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 BFARQ9NZS9 450 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 GGT7Q9UJ14 662 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 SPATA2Q9UM82 520 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 ABCA9Q8IUA7 1624 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 A0A1W2PQ27 194 aa7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms