RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 SPDYE5A6NIY4 337 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 GYG1P46976 350 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SPDYE7PQ495Y7 208 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SLFN13Q68D06 897 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ITM2BQ9Y287 266 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 UTYO14607 1347 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 C21orf2O43822 256 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 IL18RAPO95256 599 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 MLNP12872 115 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM270Q6UE05 265 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 GLYCTKQ8IVS8 523 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 THNSL1Q8IYQ7 743 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SKA1Q96BD8 255 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 PPP1R16BQ96T49 567 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 HUS1O60921 280 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC2A3P11169 496 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 RARGP13631 454 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 BTDP43251 543 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 KCTD2Q14681 263 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 GRIP2Q9C0E4 1043 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 APEX2Q9UBZ4 518 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 POLG2Q9UHN1 485 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 RBP1P09455 135 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ITGA8P53708 1063 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 TEX46H3BTG2 121 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CLDN3O15551 220 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 DLGAP5Q15398 846 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CHI3L2Q15782 390 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SEL1L3Q68CR1 1132 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 OR8H2Q8N162 312 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CAPSLQ8WWF8 208 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 UBE2QL1A1L167 161 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 GLI1P08151 1106 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 MYL12AP19105 171 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 GTF2H1P32780 548 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ARPC4P59998 168 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 FIGNQ5HY92 759 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 FKBP9P1Q75LS8 142 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 STRA8Q7Z7C7 330 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 DCUN1D1Q96GG9 259 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CYLDQ9NQC7 956 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SPACA6W5XKT8 324 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 AP3S2P59780 193 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ACOT12Q8WYK0 555 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 MAGEE1Q9HCI5 957 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CASS4Q9NQ75 786 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 FESP07332 822 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 TPCN2Q8NHX9 752 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 MAP3K14Q99558 947 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 S100A6P06703 90 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 GARTP22102 1010 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 PRELPP51888 382 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 GNA13Q14344 377 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 TTMPQ5BVD1 217 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 TAS2R42Q7RTR8 314 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ADSSL1Q8N142 457 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 TFR2Q9UP52 801 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 IPPQ9Y573 584 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SFI1A8K8P3 1242 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC130P13994 396 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ACADLP28330 430 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SOX11P35716 441 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 DUOXA2Q1HG44 320 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SGMS1Q86VZ5 419 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 UNC45BQ8IWX7 931 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 C9orf72Q96LT7 481 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 VTA1Q9NP79 307 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 MYO5BQ9ULV0 1848 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNN4O15554 427 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 PPP2R1BP30154 601 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 TRAF3Q13114 568 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGEF19Q8IW93 802 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 C8orf37Q96NL8 207 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 C7orf25Q9BPX7 421 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 PCMTD2Q9NV79 361 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 MAGEB2O15479 319 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ANXA9O76027 345 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SEMA3DO95025 777 aa10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms