RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299194.5

LRTM2-201, Transcript of leucine rich repeats and transmembrane domains 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LRTM2, Length 3,688 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTM2-201ENST00000299194 TXNRD2Q9NNW7 524 aa13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 PCMTD2Q9NV79 361 aa13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 A6NJR5 290 aa13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 USP2O75604 605 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 ARFIP2P53365 341 aa13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 MGAT5Q09328 741 aa13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 LBX2Q6XYB7 198 aa13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 OTOAQ7RTW8 1153 aa13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 AGAP3Q96P47 875 aa13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 CYTH2Q99418 400 aa13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 A8MXQ7 604 aa13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 CREB3O43889 395 aa13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 F7P08709 466 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 GPD1P21695 349 aa13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 ASPAP45381 313 aa13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 RAD23BP54727 409 aa13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 GPX6P59796 221 aa13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 MAP3K10Q02779 954 aa13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 DPYSL3Q14195 570 aa13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 CATSPER4Q7RTX7 472 aa13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 FAM172AQ8WUF8 416 aa13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 TSSK1BQ9BXA7 367 aa13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 TRIM55Q9BYV6 548 aa13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 TMEM134Q9H6X4 195 aa13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 MANSC1Q9H8J5 431 aa13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 SIGLEC16A6NMB1 481 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 I3L4J1 428 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 NUMBP49757 651 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 CCDC62Q6P9F0 684 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 RFWD2Q8NHY2 731 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 SLCO2A1Q92959 643 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 ACAP3Q96P50 834 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 GPR20Q99678 358 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 SLC12A4Q9UP95 1085 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 A0A1B0GUA9 196 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 ALOX15BO15296 676 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 LSM8O95777 96 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 AKAP5P24588 427 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 AP3M2P53677 418 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 KDSRQ06136 332 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 NR1H3Q13133 447 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 TTLL4Q14679 1199 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 KLHL38Q2WGJ6 581 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 CES3Q6UWW8 571 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 DPP9Q86TI2 863 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 IGDCC3Q8IVU1 814 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 GRID1Q9ULK0 1009 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 SHOC2Q9UQ13 582 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 ENTPD5O75356 428 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 CGB2Q6NT52 195 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 PCGF5Q86SE9 256 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 HIPK4Q8NE63 616 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 DPP3Q9NY33 737 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 TXNDC16Q9P2K2 825 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 CHKBQ9Y259 395 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 NRXN2Q9P2S2 1712 aa13.53□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 GYG2O15488 501 aa13.52□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 DCTN3O75935 186 aa13.52□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 GSTA1P08263 222 aa13.52□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 IQCF3P0C7M6 154 aa13.52□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 TAP1Q03518 808 aa13.52□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 NME3Q13232 169 aa13.52□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 FAM131BQ86XD5 332 aa13.52□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 XYLT1Q86Y38 959 aa13.52□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 RNF169Q8NCN4 708 aa13.52□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 GPRC5DQ9NZD1 345 aa13.52□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 CLUHO75153 1309 aa13.52□□□□□ -0.24
LRTM2-201ENST00000299194 HAUS5O94927 633 aa13.52□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 ASMTLO95671 621 aa13.52□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 BAG2O95816 211 aa13.52□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 IREB2P48200 963 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 RABGGTBP53611 331 aa13.52□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 BNIP1Q12981 228 aa13.52□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 TFDP2Q14188 446 aa13.52□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa13.52□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 SLC4A11Q8NBS3 891 aa13.52□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 NT5C1AQ9BXI3 368 aa13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms