RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271636.11

CGN-201, Transcript of cingulin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CGN, Length 5,091 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGN-201ENST00000271636 BTBD19C9JJ37 291 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 FAM107AO95990 144 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 EGFRP00533 1210 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 ERBB2P04626 1255 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 NFICP08651 508 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 TMPRSS15P98073 1019 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 ORC1Q13415 861 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 ZNF446Q9NWS9 450 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 LGR5O75473 907 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 SASH3O75995 380 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 MMP3P08254 477 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 KCNA3P22001 575 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 SLC6A3Q01959 620 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 RASSF3Q86WH2 238 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 LRRC57Q8N9N7 239 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 PTGISQ16647 500 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 SLFN11Q7Z7L1 901 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 ATPAF2Q8N5M1 289 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 APBB2Q92870 758 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 IKZF4Q9H2S9 585 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 KANSL3Q9P2N6 904 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 RECQL4O94761 1208 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 TTC4O95801 387 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 RPSAP08865 295 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 NCAM1P13591 858 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 BFSP2Q13515 415 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 E2F5Q15329 346 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 CHADLQ6NUI6 762 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 NAT9Q9BTE0 207 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 COLEC11Q9BWP8 271 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 SLC24A2Q9UI40 661 aa15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 M0QYT0 321 aa15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 NCAM2O15394 837 aa15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 MUM1Q2TAK8 710 aa15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 RGMBQ6NW40 437 aa15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 GBP5Q96PP8 586 aa15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 AP4E1Q9UPM8 1137 aa15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 TFRCP02786 760 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 S100BP04271 92 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 TAC1P20366 129 aa15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 NR2C2P49116 596 aa15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 FAM118BQ9BPY3 351 aa15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 SIK2Q9H0K1 926 aa15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 ZFATQ9P243 1243 aa15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 RBPJLQ9UBG7 517 aa15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 ANKRD65E5RJM6 399 aa15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 FSCN2O14926 492 aa15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 RPL21P46778 160 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 UGP2Q16851 508 aa15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 ERMARDQ5T6L9 678 aa15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 ACTL9Q8TC94 416 aa15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 B3GAT3O94766 335 aa15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 NFKBIAP25963 317 aa15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 IFT43Q96FT9 208 aa15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 HAUS8Q9BT25 410 aa15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa15.49■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 SPRYD7Q5W111 196 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 EMC1Q8N766 993 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 HSFY1Q96LI6 401 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 SYT15Q9BQS2 421 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 SMYD3Q9H7B4 428 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 PDGFCQ9NRA1 345 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 WDR91A4D1P6 747 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 KIF3CO14782 793 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 APOC2P02655 101 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 PTP4A2Q12974 167 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 MTA1Q13330 715 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 KCNT1Q5JUK3 1230 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 EEF1DP3Q658K8 133 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 NDUFAF2Q8N183 169 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 ELMOD1Q8N336 334 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 BRD8Q9H0E9 1235 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 KRT82Q9NSB4 513 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 TMEM120BA0PK00 339 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 H7C4K7 107 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 ADSSP30520 456 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 CDH8P55286 799 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 PCDHB18PQ96TA0 734 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 TJP2Q9UDY2 1190 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 BAG5Q9UL15 447 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 PCDHGC3Q9UN70 934 aa15.48■□□□□ 0.07
CGN-201ENST00000271636 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms