RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa22.14■■□□□ 1.13
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ODC1-201ENST00000234111 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ODC1-201ENST00000234111 C6orf229H3BNL8 230 aa22.14■■□□□ 1.13
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ODC1-201ENST00000234111 CD151P48509 253 aa22.14■■□□□ 1.13
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ODC1-201ENST00000234111 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.13■■□□□ 1.13
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ODC1-201ENST00000234111 NAT8LQ8N9F0 302 aa22.12■■□□□ 1.13
ODC1-201ENST00000234111 TBCCD1Q9NVR7 557 aa22.12■■□□□ 1.13
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ODC1-201ENST00000234111 ZNF696Q9H7X3 374 aa22.12■■□□□ 1.13
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ODC1-201ENST00000234111 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.11■■□□□ 1.13
ODC1-201ENST00000234111 RCOR2Q8IZ40 523 aa22.11■■□□□ 1.13
ODC1-201ENST00000234111 AHI1Q8N157 1196 aa22.11■■□□□ 1.13
ODC1-201ENST00000234111 Q9H521 79 aa22.11■■□□□ 1.13
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ODC1-201ENST00000234111 KCNQ2O43526 872 aa22.11■■□□□ 1.13
ODC1-201ENST00000234111 ITGAVP06756 1048 aa22.11■■□□□ 1.13
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ODC1-201ENST00000234111 SLC13A1Q9BZW2 595 aa22.11■■□□□ 1.13
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ODC1-201ENST00000234111 ZNF180Q9UJW8 692 aa22.1■■□□□ 1.13
ODC1-201ENST00000234111 PLLPQ9Y342 182 aa22.1■■□□□ 1.13
ODC1-201ENST00000234111 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.1■■□□□ 1.13
ODC1-201ENST00000234111 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.1■■□□□ 1.13
ODC1-201ENST00000234111 A0A1B0GTW7 788 aa22.1■■□□□ 1.13
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