RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039517.10

Syde2-201, Transcript of Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Syde2, Length 5,495 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2-201ENSMUST00000039517 Trpc7Q9WVC5 862 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ccdc8D3YZV8 685 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Sel1l3Q80TS8 1137 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Mical2Q8BML1 960 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Mettl16Q9CQG2 553 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Stau1Q9Z108 487 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tada2bD3Z4Z0 420 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Usp17lbE9Q9U0 468 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tnfrsf11bO08712 401 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 GemP55041 295 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Erbb2P70424 1256 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 GmpsQ3THK7 693 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Bpifb5Q3UQ05 490 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Celf6Q7TN33 460 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gtf3c4Q8BMQ2 817 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Snx17Q8BVL3 470 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 PnocQ64387 187 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ddhd1Q80YA3 547 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Elmo3Q8BYZ7 720 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Nox1Q8CIZ9 591 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Pphln1Q8K2H1 381 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Olfr615Q8VGY4 313 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Serpina3nQ91WP6 418 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 RalbQ9JIW9 206 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Dip2bQ3UH60 1574 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Rhbdl2A2AGA4 302 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Celf5D3Z4T1 395 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 ArP19091 899 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cd19P25918 547 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Calb2Q08331 271 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Elac2Q80Y81 831 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Pgs1Q8BHF7 553 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ldlrap1Q8C142 308 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tbrg4Q91YM4 630 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Q9D1F3 157 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tmem59Q9QY73 323 aa21.56■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ism1A2ATD1 454 aa21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ifit3bE9PV48 403 aa21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Atp9aO70228 1047 aa21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Traf2P39429 501 aa21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Rps12P63323 132 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tpp2Q64514 1262 aa21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Oma1Q9D8H7 521 aa21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Mfsd4b4J3QNS5 503 aa21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tgm2P21981 686 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ccnd1P25322 295 aa21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Brd9Q3UQU0 596 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Olfr8Q60892 310 aa21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 DcakdQ8BHC4 231 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Kirrel3Q8BR86 778 aa21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Skint6A7XUZ6 1240 aa21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Pnldc1B2RXZ1 531 aa21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 TpbpaP13438 124 aa21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Krt6aP50446 553 aa21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 CamkvQ3UHL1 512 aa21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gpd1lQ3ULJ0 351 aa21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 McuQ3UMR5 350 aa21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tagln3Q9R1Q8 199 aa21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Trim10Q9WUH5 489 aa21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Vwa5b1A9Z1V5 1215 aa21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Zfp882E9Q4R4 555 aa21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 NfiaQ02780 532 aa21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tmem237Q3V0J1 427 aa21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Mrpl1Q99N96 336 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 FopnlQ9CZS3 174 aa21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Bmp15Q9Z0L4 392 aa21.55■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Vmn2r77L7N2B7 854 aa21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Msh2P43247 935 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ephb2P54763 986 aa21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Coq7P97478 217 aa21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Fam172aQ3TNH5 417 aa21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 TbcelQ8C5W3 424 aa21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ndufaf7Q9CWG8 436 aa21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Trmt11Q9CWH5 460 aa21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Nudt5Q9JKX6 218 aa21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Rrn3B2RS91 656 aa21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Angpt2O35608 496 aa21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 PigrO70570 771 aa21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tp53P02340 387 aa21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Oxnad1Q8VE38 311 aa21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 MceeQ9D1I5 178 aa21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ptpn4Q9WU22 926 aa21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Mettl1Q9Z120 268 aa21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 PolP11369 1281 aa21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Akt1P31750 480 aa21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 FdxrQ61578 494 aa21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Phc1Q64028 1012 aa21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Fam167aQ6P1G6 215 aa21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Lsm8Q6ZWM4 96 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 DnerQ8JZM4 737 aa21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 NgrnQ99KS2 293 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Nipsnap3bQ9CQE1 247 aa21.54■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gnat1P20612 350 aa21.53■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Rgs9bpQ148R9 237 aa21.53■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gemin4Q6P6L6 1058 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Fbxo9Q8BK06 437 aa21.53■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 XpotQ9CRT8 963 aa21.53■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Sept5Q9Z2Q6 369 aa21.53■■□□□ 1.04
Syde2-201ENSMUST00000039517 Pcdh9F8VPK8 1237 aa21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.6 ms