RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rgs10Q9CQE5 181 aa13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ProcP33587 460 aa13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PrlrQ08501 608 aa13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mcm9Q2KHI9 1134 aa13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cog7Q3UM29 770 aa13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 XpaQ64267 272 aa13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rabgef1Q9JM13 491 aa13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ly6iQ9WU67 134 aa13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ddx60E9PZQ1 1711 aa13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Col1a1P11087 1453 aa13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 IkbkgO88522 412 aa13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdr36Q3TAQ9 899 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc160Q3UYG1 323 aa13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrpl47Q8K2Y7 252 aa13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 S100pbpQ9D5K4 396 aa13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HnrnpcQ9Z204 313 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp990B1AVN5 605 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NficP70255 439 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adam6bQ6IMH7 756 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 D630039A03RikQ8K0M7 236 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tbc1d15Q9CXF4 671 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 IkbipQ9DBZ1 373 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gbp6A0A0G2JDV3 611 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 A0A1Y7VP24 259 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf804aA2AKY4 1200 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ace3D0G895 737 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HmgcrQ01237 887 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dennd1bQ3U1T9 766 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P2rx5Q3UYI1 455 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CtifQ6PEE2 600 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ntrk3Q6VNS1 825 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam185aQ7TPD2 378 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Phactr3Q8BYK5 558 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdr11Q8K1X1 1223 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arfip2Q8K221 341 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fkbp6Q91XW8 327 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aff4Q9ESC8 1160 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dcun1d1Q9QZ73 259 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nwd2Q6P5U7 1742 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prrg1A2BFE8 218 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Inpp1P49442 396 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arf4P61750 180 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tbc1d1Q60949 1255 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mvb12bQ6KAU4 317 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam205cQ80YD3 371 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Daam1Q8BPM0 1077 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Agbl2Q8CDK2 862 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tbc1d13Q8R3D1 400 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MceeQ9D1I5 178 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp1r12aQ9DBR7 1029 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Birc5O70201 140 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrc6O88978 473 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kctd19Q562E2 927 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CpQ61147 1061 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HiraQ61666 1015 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf512Q69Z99 562 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nlrp4bQ8C6J9 863 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fgd4Q91ZT5 766 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp6ap2Q9CYN9 350 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nfu1Q9QZ23 255 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Iigp1Q9QZ85 413 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slfn2Q9Z0I6 378 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klrc1Q9Z202 244 aa13.31□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ttc23lA6H6E9 458 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prl6a1O35257 230 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CblP22682 913 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fbln1Q08879 705 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp2c65Q148B1 490 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vps51Q3UVL4 782 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spag6Q3V0U9 509 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smarcd1Q61466 515 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Txndc8Q69AB2 127 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 DcakdQ8BHC4 231 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gbp9Q8BTS3 619 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lgi2Q8K4Z0 550 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GldcQ91W43 1025 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc6a21A0A1B0GSD2 748 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HpdP49429 393 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NrlP54846 237 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tekt4Q149S1 447 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ints6lQ8BND4 861 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Galnt5Q8C102 930 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TwnkQ8CIW5 685 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc30a5Q8R4H9 761 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Unc93b1Q8VCW4 598 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nsmce3Q9CPR8 279 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mgea5Q9EQQ9 916 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Brwd3A2AHJ4 1799 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd70O55237 195 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PdgfraP26618 1089 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmprss11aQ3UQ41 389 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psg29Q3URN6 468 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fbxw2Q60584 422 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spon2Q8BMS2 330 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc15a5Q8CBB2 566 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd300ldQ8VCH2 221 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rin2Q9D684 903 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slfn14V9GXG1 899 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bpifb9bA2AJD1 591 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hsf3D0VYS2 492 aa13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.8 ms