RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ly6g6eQ8K1T6 166 aa20.19■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Elp2Q91WG4 831 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ces1fQ91WU0 561 aa20.19■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Prss28Q924N9 274 aa20.19■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gemin2Q9CQQ4 269 aa20.19■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rai1Q61818 1889 aa20.19■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Vsig10l2A0A140LHF2 776 aa20.18■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Vmn1r55E9Q8I6 310 aa20.18■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Vmn2r100E9QAZ9 850 aa20.18■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm20403G3UYB0 123 aa20.18■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cyp4a14O35728 507 aa20.18■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Chmp6P0C0A3 200 aa20.18■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 FurinP23188 793 aa20.18■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 TxkP42682 527 aa20.18■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Haus7Q8BKT8 364 aa20.18■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam124bQ8BLQ0 456 aa20.18■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sh3rf2Q8BZT2 735 aa20.18■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Vmn1r206Q8R277 312 aa20.18■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Socs4Q91ZA6 436 aa20.18■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Macrod1Q922B1 323 aa20.18■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Oas1cQ924S2 362 aa20.18■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fbxo32Q9CPU7 355 aa20.18■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mmp1aQ9EPL5 464 aa20.18■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dnajb8Q9QYI7 227 aa20.18■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ca14Q9WVT6 337 aa20.18■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Frem2Q6NVD0 3160 aa20.18■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 SetxA2AKX3 2646 aa20.18■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cyp2t4E9PWV0 503 aa20.17■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fbrsl1E9Q9T0 1031 aa20.17■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sdc4O35988 198 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tead2P48301 445 aa20.17■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Trappc9Q3U0M1 1148 aa20.17■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rtl3Q6P1Y1 553 aa20.17■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pcdhb14Q6PB90 796 aa20.17■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fbxo48Q8CAT8 161 aa20.17■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 DpydQ8CHR6 1025 aa20.17■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc35f5Q8R314 524 aa20.17■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc30a5Q8R4H9 761 aa20.17■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ipo4Q8VI75 1082 aa20.17■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr703Q9EPF5 319 aa20.17■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Scamp5Q9JKD3 235 aa20.17■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Asap1Q9QWY8 1147 aa20.17■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gria3Q9Z2W9 888 aa20.17■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 FrylF8VQ05 3007 aa20.17■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 NbasE9Q411 2356 aa20.16■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfc3h1B2RT41 1992 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 1700031M16RikA0A087WSH0 82 aa20.16■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mindy4b-psA0A1W2P7H6 457 aa20.16■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm5814J3QP80 125 aa20.16■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tnnc1P19123 161 aa20.16■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Irf8P23611 424 aa20.16■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 CremP27699 357 aa20.16■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lefty2P57785 368 aa20.16■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ezh1P70351 747 aa20.16■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 IhhP97812 411 aa20.16■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Adamts1P97857 968 aa20.16■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mapk6Q61532 720 aa20.16■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tas2r129Q7M709 320 aa20.16■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Camsap3Q80VC9 1252 aa20.16■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pkn2Q8BWW9 983 aa20.16■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pitrm1Q8K411 1036 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cd207Q8VBX4 331 aa20.16■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nle1Q8VEJ4 485 aa20.16■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pcdhb2Q91Y00 799 aa20.16■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pcdha11Q91Y19 950 aa20.16■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Psmd6Q99JI4 389 aa20.16■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ppp1r3gQ9CW07 347 aa20.16■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rad1Q9QWZ1 280 aa20.16■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Spry4Q9WTP2 300 aa20.16■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmem245B1AZA5 876 aa20.15■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Taf4E9QAP7 1042 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Akr1b1P45376 316 aa20.15■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 IvlP48997 467 aa20.15■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tnnt2P50752 301 aa20.15■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sh3bp1P55194 680 aa20.15■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cct6aP80317 531 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cdh8P97291 799 aa20.15■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Smyd5Q3TYX3 416 aa20.15■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 TCAIMQ66JZ4 499 aa20.15■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Bfsp2Q6NVD9 416 aa20.15■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Znf750Q8BH05 703 aa20.15■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mei4Q8BRM6 389 aa20.15■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rapgef5Q8C0Q9 814 aa20.15■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slitrk6Q8C110 840 aa20.15■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Scyl2Q8CFE4 930 aa20.15■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Q922M7 232 aa20.15■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gdpd2Q9ESM6 539 aa20.15■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rfx5Q9JL61 658 aa20.15■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pex11aQ9Z211 246 aa20.15■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mtm1Q9Z2C5 603 aa20.15■□□□□ 0.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Igkv5-45A0A0B4J1J1 115 aa20.14■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Acp4D3YTS9 425 aa20.14■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Spata31E9QAF0 1014 aa20.14■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tnfrsf11aO35305 625 aa20.14■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Eif3dO70194 548 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gsdmc2Q2KHK6 480 aa20.14■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gsdmc4Q3TR54 480 aa20.14■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 4933416C03RikQ3V063 378 aa20.14■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ccdc185Q3V118 621 aa20.14■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Myl6Q60605 151 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.3 ms