RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ctxn3Q8BXZ0 80 aa23.98■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q8BZJ8 459 aa23.98■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kctd15Q8K0E1 283 aa23.98■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Scrn2Q8VCA8 425 aa23.98■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Acbd6Q9D061 282 aa23.98■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cmtr1Q9DBC3 837 aa23.98■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Asb3Q9WV72 525 aa23.98■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stau1Q9Z108 487 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 A0A286YCQ6 122 aa23.97■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ttc17E9PVB5 1198 aa23.97■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ly6aP05533 134 aa23.97■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PkmP52480 531 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Agxt2Q3UEG6 513 aa23.97■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zbtb16Q3UQ17 673 aa23.97■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Jak2Q62120 1129 aa23.97■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bend7Q8BSV3 434 aa23.97■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dnm3Q8BZ98 863 aa23.97■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CgasQ8C6L5 507 aa23.97■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AspmQ8CJ27 3122 aa23.97■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 RabepkQ8VCH5 380 aa23.97■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam114a2Q8VE88 497 aa23.97■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pard3bQ9CSB4 1203 aa23.97■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ddit4Q9D3F7 229 aa23.97■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q9D4A5 307 aa23.97■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Itga2bQ9QUM0 1033 aa23.97■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slfn14V9GXG1 899 aa23.97■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Col12a1Q60847 3120 aa23.97■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rad51ap2G3UW63 976 aa23.96■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 RhoP15409 348 aa23.96■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Folr1P35846 255 aa23.96■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smyd1P97443 490 aa23.96■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CttnQ60598 546 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MslnQ61468 625 aa23.96■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Six2Q62232 296 aa23.96■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Frmd5Q6P5H6 517 aa23.96■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hmgb4Q6P8W9 181 aa23.96■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cachd1Q6PDJ1 1288 aa23.96■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Naif1Q6PFD7 327 aa23.96■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cacna2d2Q6PHS9 1154 aa23.96■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lats2Q7TSJ6 1042 aa23.96■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rasal3Q8C2K5 1041 aa23.96■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ano2Q8CFW1 1002 aa23.96■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trmt11Q9CWH5 460 aa23.96■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Chordc1Q9D1P4 331 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam174aQ9D3L0 190 aa23.96■■□□□ 1.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 506 aa23.95■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm45261A0A1B0GSP6 197 aa23.95■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm1993A6X8I0 212 aa23.95■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Syce3B5KM66 88 aa23.95■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SlxD3Z347 212 aa23.95■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp266E9Q2S7 604 aa23.95■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cdh18E9Q9Q6 790 aa23.95■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ebf3O08791 596 aa23.95■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppp4r3cQ3V0Y1 813 aa23.95■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Eri2Q5BKS4 688 aa23.95■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arnt2Q61324 712 aa23.95■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Xpo1Q6P5F9 1071 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcnt1Q6ZPR4 1224 aa23.95■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tas2r134Q7TQB0 298 aa23.95■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Abi3Q8BYZ1 367 aa23.95■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mettl3Q8C3P7 580 aa23.95■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Angel1Q8VCU0 667 aa23.95■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ipo4Q8VI75 1082 aa23.95■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lpin3Q99PI4 848 aa23.95■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rpl4Q9D8E6 419 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rasgrp1Q9Z1S3 795 aa23.95■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf106O88466 1888 aa23.95■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Afg1lQ3V384 480 aa23.94■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Krt39Q6IFX4 482 aa23.94■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr26Q7TRB7 308 aa23.94■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adam29Q811Q4 763 aa23.94■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmco3Q8BH01 678 aa23.94■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arhgef33Q8BW86 850 aa23.94■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Uba3Q8C878 462 aa23.94■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rwdd2aQ9D9S3 292 aa23.94■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr933Q9EQA0 308 aa23.94■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc2a5Q9WV38 501 aa23.94■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PapolbQ9WVP6 641 aa23.94■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rpl9-ps1S4R1R7 191 aa23.94■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Alpk2Q91ZB0 2144 aa23.93■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Igkv10-94A0A075B5L1 115 aa23.93■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Igkv5-43A0A0B4J1J2 115 aa23.93■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Farp1F8VPU2 1048 aa23.93■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Man2b1O09159 1013 aa23.93■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sdc4O35988 198 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nudt18Q3U2V3 323 aa23.93■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Taar7eQ5QD09 358 aa23.93■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfm2Q8BM13 448 aa23.93■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zc3h3Q8CHP0 950 aa23.93■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mill2Q8HWE5 355 aa23.93■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NeproQ8R2U2 564 aa23.93■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gramd1aQ8VEF1 722 aa23.93■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pth2rQ91V95 546 aa23.93■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Med7Q9CZB6 233 aa23.93■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rab11fip1Q9D620 645 aa23.93■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rin2Q9D684 903 aa23.93■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Necab3Q9D6J4 353 aa23.93■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Copb1Q9JIF7 953 aa23.93■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 IkbkeQ9R0T8 717 aa23.93■■□□□ 1.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stk25Q9Z2W1 426 aa23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.2 ms