RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W YHR130CP38834 111 aa7.99□□□□□ -1.13
PRP4YPR178W PEX17P40155 199 aa7.99□□□□□ -1.13
PRP4YPR178W FIP1P45976 327 aa7.99□□□□□ -1.13
PRP4YPR178W SBH2P52871 88 aa7.99□□□□□ -1.13
PRP4YPR178W YPR053CQ6Q5F3 151 aa7.99□□□□□ -1.13
PRP4YPR178W YOL085CQ99345 113 aa7.98□□□□□ -1.13
PRP4YPR178W UGX2P32772 223 aa7.97□□□□□ -1.13
PRP4YPR178W YAL063C-AQ3E791 96 aa7.97□□□□□ -1.13
PRP4YPR178W RPL28P02406 149 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PRP4YPR178W MRPS12P53732 153 aa7.97□□□□□ -1.13
PRP4YPR178W RPL16AP26784 199 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W MID2P36027 376 aa7.95□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W DSE2P38844 325 aa7.95□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W YNL194CP40169 301 aa7.95□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W YIA6P40556 373 aa7.95□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W ABF2Q02486 183 aa7.95□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W YPL080CQ02826 108 aa7.95□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W YML122CQ03207 126 aa7.95□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa7.95□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W YFL041W-AQ3E817 63 aa7.95□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W FMP27Q06179 2628 aa7.94□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W YPR117WQ06116 2489 aa7.93□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W TRP1P00912 224 aa7.93□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W Q0255P03881 472 aa7.92□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W SKI6P46948 246 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W YNL190WP53872 204 aa7.92□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W RPL16BP26785 198 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W YGL260WP53056 76 aa7.91□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W CSF1Q12150 2958 aa7.9□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W SHU1P38751 150 aa7.9□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W COX12Q01519 83 aa7.9□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W YPR013CQ12145 317 aa7.9□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W YOR011W-AQ3E807 68 aa7.9□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W YPL229WQ99395 206 aa7.9□□□□□ -1.14
PRP4YPR178W QCR8P08525 94 aa7.89□□□□□ -1.15
PRP4YPR178W YKL069WP36088 180 aa7.89□□□□□ -1.15
PRP4YPR178W YLR042CQ07990 161 aa7.89□□□□□ -1.15
PRP4YPR178W NRG2P38082 220 aa7.88□□□□□ -1.15
PRP4YPR178W YIR020CP40575 100 aa7.88□□□□□ -1.15
PRP4YPR178W SPS100P13130 326 aa7.87□□□□□ -1.15
PRP4YPR178W YER135CP40082 130 aa7.87□□□□□ -1.15
PRP4YPR178W YPL278CQ08990 100 aa7.87□□□□□ -1.15
PRP4YPR178W INO2P26798 304 aa7.86□□□□□ -1.15
PRP4YPR178W YIR021W-AQ3E739 70 aa7.86□□□□□ -1.15
PRP4YPR178W TOA2P32774 122 aa7.85□□□□□ -1.15
PRP4YPR178W AIM19P40502 157 aa7.85□□□□□ -1.15
PRP4YPR178W TOS8P53147 276 aa7.85□□□□□ -1.15
PRP4YPR178W YMR317WQ04893 1140 aa7.85□□□□□ -1.15
PRP4YPR178W VPS55P47111 140 aa7.84□□□□□ -1.15
PRP4YPR178W YBR209WP38311 105 aa7.84□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W YEL008WP40001 126 aa7.84□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W HUR1P45820 110 aa7.84□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W RPL15AP05748 204 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W VMA11P32842 164 aa7.83□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W YDR381C-AQ3E6R5 114 aa7.83□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W YCL021W-AQ96VH3 125 aa7.83□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W YHR139C-AO13536 103 aa7.82□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W MIG3P39943 394 aa7.82□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W SIM1P40472 476 aa7.82□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W YGR039WP53225 103 aa7.82□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W ENV10Q99382 181 aa7.82□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W IRA2P19158 3079 aa7.82□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W RAD6P06104 172 aa7.81□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W RRT13P40042 185 aa7.81□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W YCH1P42937 148 aa7.81□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W YDL186WP48568 277 aa7.81□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W YGL088WP53151 121 aa7.81□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W CAX4P53223 239 aa7.81□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W YMR244WQ04018 355 aa7.81□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W TIM10P87108 93 aa7.8□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W PBA1Q05778 276 aa7.8□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W HOR7Q05827 59 aa7.8□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W YDR119W-AQ2V2P9 66 aa7.8□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W MSN1P22148 382 aa7.79□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W MRPS8Q03799 155 aa7.79□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W YBL112CQ3E7Y4 105 aa7.79□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W COF1Q03048 143 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W SPG4Q04438 115 aa7.78□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W SPO24Q3E752 67 aa7.78□□□□□ -1.16
PRP4YPR178W MSA2P36157 363 aa7.77□□□□□ -1.17
PRP4YPR178W SVP26P38869 228 aa7.77□□□□□ -1.17
PRP4YPR178W CWP2P43497 92 aa7.77□□□□□ -1.17
PRP4YPR178W RGM1Q00453 211 aa7.77□□□□□ -1.17
PRP4YPR178W MPC2P38857 129 aa7.76□□□□□ -1.17
PRP4YPR178W PMP3P87284 55 aa7.76□□□□□ -1.17
PRP4YPR178W PPT2Q12036 173 aa7.76□□□□□ -1.17
PRP4YPR178W SMP1P38128 452 aa7.75□□□□□ -1.17
PRP4YPR178W YHL042WP38729 150 aa7.75□□□□□ -1.17
PRP4YPR178W YIL059CP40520 121 aa7.75□□□□□ -1.17
PRP4YPR178W YAR029WP39549 74 aa7.74□□□□□ -1.17
PRP4YPR178W YFR035CP43608 114 aa7.74□□□□□ -1.17
PRP4YPR178W YOR020W-AQ3E824 90 aa7.74□□□□□ -1.17
PRP4YPR178W UBC5P15732 148 aa7.72□□□□□ -1.17
PRP4YPR178W SHH4Q06236 168 aa7.72□□□□□ -1.17
PRP4YPR178W BPH1P25356 2167 aa7.72□□□□□ -1.17
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