RNA–Protein interactions for RNA: YPL179W

PPQ1, Transcript of Protein phosphatase that regulates the mating response, yeast

Gene PPQ1, Length 1,650 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPQ1	YPL179W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PPQ1	YPL179W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PPQ1	YPL179W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PPQ1	YPL179W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PPQ1	YPL179W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PPQ1	YPL179W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PPQ1	YPL179W	YBR209W	P38311	105 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PPQ1	YPL179W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PPQ1	YPL179W	YJR146W	P47174	117 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PPQ1	YPL179W	HMRA2	P0CY13	119 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	TOS6	P48560	102 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	YDR042C	Q03205	200 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	DPP1	Q05521	289 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	COA3	Q3E7B2	85 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	SCS22	Q6Q595	175 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	STF1	P01098	86 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	AIM29	P36154	155 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	2.7	□□□□□ -1.98	not detected
PPQ1	YPL179W	YIL059C	P40520	121 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	RPR2	P40571	144 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	PMP3	P87284	55 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	PAU16	P35994	123 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	MRP49	P32388	137 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	YBR219C	P38317	127 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	YEL008W	P40001	126 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	YER085C	P40058	173 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	YMR103C	Q04436	120 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	SEC11	P15367	167 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	ATP15	P21306	62 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	ERV14	P53173	138 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	PBA1	Q05778	276 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	RRT15	Q3E811	62 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	TRP1	P00912	224 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	YCR007C	P25354	239 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	YKL070W	P36087	169 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	YDR115W	Q04598	105 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	YPR195C	Q06594	109 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	COA6	Q3E846	104 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	YEL067C	P39978	195 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	HAC1	P41546	238 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	YMR320W	Q04897	101 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	CNL1	Q06333	122 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	FUN14	P18411	198 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	APS1	P35181	156 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	SPC1	P46965	94 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	YGL230C	P53074	147 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	AIM11	P87275	137 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	YMR295C	Q03559	197 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	NAT5	Q08689	176 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	YDL157C	Q12082	118 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PPQ1	YPL179W	MRPL44	P19956	98 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	SCM4	P32564	187 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	SVP26	P38869	228 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	2.64	□□□□□ -1.99	not detected
PPQ1	YPL179W	BET5	Q03630	159 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	YLR194C	Q05777	254 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	YPL261C	Q08976	102 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	RTC6	O14464	93 aa		2.63	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	YKR041W	P36134	250 aa		2.63	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	YAL064W	P39711	94 aa		2.63	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	ERG28	P40030	148 aa		2.63	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	CIN5	P40917	295 aa		2.63	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	MRPS12	P53732	153 aa		2.63	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	YNR077C	P53758	84 aa		2.63	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	EOS1	P53938	366 aa		2.63	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	SHU1	P38751	150 aa		2.62	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	RPC10	P40422	70 aa		2.62	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	CGR1	P53188	120 aa		2.62	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	YNL190W	P53872	204 aa		2.62	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	YAL065C	O13511	128 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	YKL044W	P36092	106 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PPQ1	YPL179W	YPL073C	P40323	161 aa		2.61	□□□□□ -1.99

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