RNA–Protein interactions for RNA: YPL147W

PXA1, Transcript of Subunit of a heterodimeric peroxisomal ABC transport complex, yeast

Gene PXA1, Length 2,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria, Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PXA1	YPL147W	YOL118C	Q08259	102 aa		3.83	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	FYV12	Q08559	129 aa		3.83	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	MDM35	O60200	86 aa		3.82	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	YDR102C	Q03864	110 aa		3.82	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	YOR343C	Q12484	108 aa		3.82	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	MAK31	P23059	88 aa		3.82	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	3.82	□□□□□ -1.8	not detected
PXA1	YPL147W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	NPC2	Q12408	173 aa		3.82	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	ICS3	P47034	131 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	YJL028W	P47062	111 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	ATO3	Q12359	275 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	NCA3	P46955	337 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	PIR1	Q03178	341 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	PBA1	Q05778	276 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	MIM1	Q08176	113 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	YCR025C	P25352	136 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	MSA2	P36157	363 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	3.8	□□□□□ -1.8	not detected
PXA1	YPL147W	ECO1	P43605	281 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	PAU2	P32612	120 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	YDR274C	P87283	123 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	ATP15	P21306	62 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	SAP30	P38429	201 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	YFL015C	P43578	164 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	BOL2	P53082	120 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	SOM1	Q05676	74 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	TIM22	Q12328	207 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PXA1	YPL147W	ASK1	P35734	292 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	CIS3	P47001	227 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	YOR314W	Q12506	109 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	MHF2	Q3E829	80 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	YEL073C	P39974	107 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	PAU12	P53343	120 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	YPL261C	Q08976	102 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	RPL43B	P0CX26	92 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	SPI1	P40092	148 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	IMP2	P46972	177 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	AYT1	Q12226	474 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	TIM9	O74700	87 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	AIM19	P40502	157 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	SRL1	Q08673	210 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	CRC1	Q12289	327 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	YAL065C	O13511	128 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	ROX3	P25046	220 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	OST5	Q92316	86 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	LAA1	P39526	2014 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	FLO9	P39712	1322 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	UTH1	P36135	365 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	ATP20	Q12233	115 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	PAU24	P38155	120 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	RGM1	Q00453	211 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	MIX17	Q03667	156 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	IRC19	Q07843	230 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	IRC23	Q08416	157 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	CTR2	P38865	189 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	RRT1	P38192	103 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	YSY6	P38374	65 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	YBR209W	P38311	105 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	MPC3	P53311	146 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	PIR3	Q03180	325 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	YOL029C	Q08187	201 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	PPT2	Q12036	173 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	MET32	Q12041	191 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	YHR173C	P38864	112 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	YOR268C	Q08734	132 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
PXA1	YPL147W	VPS55	P47111	140 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	BRP1	P53194	125 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	YLR162W	Q06235	118 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	IRA2	P19158	3079 aa		3.7	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		3.7	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	YHL037C	P38733	133 aa		3.69	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		3.69	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	COA3	Q3E7B2	85 aa		3.69	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	IRA1	P18963	3092 aa		3.69	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	YBL059W	P34224	193 aa		3.69	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	YGL118C	P53132	145 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	YIR020C	P40575	100 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	QCR9	P22289	66 aa		3.67	□□□□□ -1.82

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