RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	PCL2	P25693	308 aa		4.3	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	AGA1	P32323	725 aa		4.3	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	YER076C	P40049	302 aa		4.3	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	VHS2	P40463	436 aa		4.3	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	DYN1	P36022	4092 aa		4.3	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	MLF3	P32047	452 aa		4.29	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	KEG1	P43614	200 aa		4.29	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	YFR057W	P43625	151 aa		4.29	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	YDR042C	Q03205	200 aa		4.29	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.29	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		4.29	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.29	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	YML079W	Q03629	201 aa		4.29	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		4.29	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	YEL067C	P39978	195 aa		4.28	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	COX12	Q01519	83 aa		4.28	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	YLR122C	Q12312	125 aa		4.28	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	YKL069W	P36088	180 aa		4.27	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	YPL073C	P40323	161 aa		4.27	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	YFR035C	P43608	114 aa		4.27	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	YCH1	P42937	148 aa		4.27	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	AIM34	Q03673	198 aa		4.27	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	YPL261C	Q08976	102 aa		4.27	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	Q0255	P03881	472 aa		4.26	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	INO4	P13902	151 aa		4.26	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	GLO1	P50107	326 aa		4.26	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	YLR112W	Q12130	139 aa		4.26	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.26	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	MGR2	Q02889	113 aa		4.26	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.26	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	MID2	P36027	376 aa		4.25	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	YGL088W	P53151	121 aa		4.25	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	ELC1	Q03071	99 aa		4.25	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.25	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.25	□□□□□ -1.73	not detected
AMD1	YML035C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.25	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.24	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	PFY1	P07274	126 aa		4.24	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	OXA1	P39952	402 aa		4.24	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	RRT13	P40042	185 aa		4.24	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.24	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	YKL070W	P36087	169 aa		4.24	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	ATP15	P21306	62 aa		4.23	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	YKL044W	P36092	106 aa		4.23	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	YBR209W	P38311	105 aa		4.23	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	ATX1	P38636	73 aa		4.23	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	YNR077C	P53758	84 aa		4.23	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	YPL080C	Q02826	108 aa		4.23	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	YFL065C	P43539	102 aa		4.22	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	OST2	P46964	130 aa		4.22	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	YPS5	P53057	165 aa		4.22	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	EOS1	P53938	366 aa		4.22	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	VAM10	Q08474	114 aa		4.22	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	YPR203W	Q08994	102 aa		4.22	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	AUA1	P32450	94 aa		4.22	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	NRG2	P38082	220 aa		4.22	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	AIM11	P87275	137 aa		4.22	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	YLR042C	Q07990	161 aa		4.22	□□□□□ -1.73
AMD1	YML035C	DCV1	P43595	202 aa		4.21	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	YNL190W	P53872	204 aa		4.21	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	YLR296W	Q05898	108 aa		4.21	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	YKR041W	P36134	250 aa		4.21	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	TOS6	P48560	102 aa		4.21	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	MET32	Q12041	191 aa		4.21	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		4.21	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.21	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	YER085C	P40058	173 aa		4.2	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	YPL229W	Q99395	206 aa		4.2	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	SGF11	Q03067	99 aa		4.2	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	YCR001W	P25347	104 aa		4.19	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	YNL217W	P40152	326 aa		4.19	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	TOA2	P32774	122 aa		4.19	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	YHR130C	P38834	111 aa		4.19	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	KRE9	P39005	276 aa		4.19	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	YER181C	P40097	107 aa		4.19	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		4.19	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	DUT1	P33317	147 aa		4.18	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	YIL059C	P40520	121 aa		4.17	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	UBC5	P15732	148 aa		4.16	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	COX10	P21592	462 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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