RNA–Protein interactions for RNA: YKL214C

YRA2, Transcript of Member of the REF (RNA and export factor binding proteins) family, yeast

Gene YRA2, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YRA2	YKL214C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YRA2	YKL214C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YRA2	YKL214C	RPS23B	P0CX30	145 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YRA2	YKL214C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.09	□□□□□ -1.91	not detected
YRA2	YKL214C	NRG2	P38082	220 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YRA2	YKL214C	KRE9	P39005	276 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YRA2	YKL214C	CYB5	P40312	120 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YRA2	YKL214C	DAN1	P47178	298 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YRA2	YKL214C	SEN15	Q04675	128 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YRA2	YKL214C	YLR296W	Q05898	108 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YRA2	YKL214C	YPR195C	Q06594	109 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YRA2	YKL214C	YDL157C	Q12082	118 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YRA2	YKL214C	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	CUP1-1	P0CX80	61 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	CUP1-2	P0CX81	61 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	STF2	P16965	84 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	HPA3	P39979	161 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	YDR042C	Q03205	200 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	YPL261C	Q08976	102 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	YBR013C	P38215	129 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	DCV1	P43595	202 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	NAT5	Q08689	176 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	FUN14	P18411	198 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	YCR085W	P25650	117 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	HSP10	P38910	106 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	DAD1	Q12248	94 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	OST5	Q92316	86 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	YHL005C	P38752	130 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	YFL065C	P43539	102 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	YFL012W	P43580	148 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	YPR203W	Q08994	102 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	RRT15	Q3E811	62 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	FMP27	Q06179	2628 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	RTC6	O14464	93 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	YHR213W	P0CI67	198 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	YBR209W	P38311	105 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	CWP2	P43497	92 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	BOL2	P53082	120 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	YIR020C	P40575	100 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	PRM3	Q08931	133 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YRA2	YKL214C	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	COX8	P04039	78 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	YPI1	P43587	155 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	PAU12	P53343	120 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	YDR114C	Q04597	100 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	EMC6	Q12431	108 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	STT4	P37297	1900 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	KRE1	P17260	313 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	PAU2	P32612	120 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	YFL051C	P43552	160 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	RGM1	Q00453	211 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	ENV10	Q99382	181 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	PAI3	P01094	68 aa		3	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	HSP150	P32478	413 aa		3	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	SWM2	P40342	146 aa		3	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	YGL260W	P53056	76 aa		3	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	MET31	Q03081	177 aa		3	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	TOR1	P35169	2470 aa		3	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	SEC11	P15367	167 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	YEL014C	P39999	101 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	RSM18	P40033	138 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	YGL149W	P53116	101 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	YIL014C-A	Q02598	104 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	FIT2	Q08906	153 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	TOM6	P33448	61 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	SNN1	P48232	102 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	ICY1	Q04329	127 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	CMC4	Q3E7A9	73 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	MHF1	Q3E835	90 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	PAU19	P0CE85	124 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	PAU3	P25610	124 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	RPB7	P34087	171 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	PAU24	P38155	120 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	YIL086C	P40503	102 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	DAD4	P69851	72 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	PCC1	Q3E833	88 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	IRA2	P19158	3079 aa		2.96	□□□□□ -1.93
YRA2	YKL214C	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94

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