RNA–Protein interactions for RNA: YKL033W

TTI1, Transcript of Subunit of the ASTRA complex, involved in chromatin remodeling, yeast

Gene TTI1, Length 3,117 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TTI1	YKL033W	ZRT1	P32804	376 aa		0.66	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YEL008W	P40001	126 aa		0.66	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YNR066C	P53752	436 aa		0.66	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YMR295C	Q03559	197 aa		0.66	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	CMC4	Q3E7A9	73 aa		0.66	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		0.66	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		0.65	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YHR140W	P38842	239 aa		0.65	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	0.65	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	DAD3	P69850	94 aa		0.65	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YGL010W	P25338	174 aa		0.64	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YBR027C	P38220	110 aa		0.64	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	ATP15	P21306	62 aa		0.64	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	COX10	P21592	462 aa		0.64	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	SPC25	P40014	221 aa		0.64	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	SPG1	P50088	95 aa		0.64	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YGR026W	P53217	278 aa		0.64	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		0.64	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	ECM12	O13529	151 aa		0.64	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	AQY2	P0CD90	149 aa		0.64	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	KRE1	P17260	313 aa		0.64	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YNL190W	P53872	204 aa		0.64	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YOR105W	Q08504	108 aa		0.64	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		0.64	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	PAU1	P0CE88	120 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	PAU14	P0CE89	120 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	PAU6	P0CE90	120 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	PAU18	P0CE91	120 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	PAU8	P0CE92	120 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	PAU11	P0CE93	120 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	PAU13	P38725	120 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	VMA7	P39111	118 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	PAU4	P53427	120 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	MGR2	Q02889	113 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	PAU10	Q03050	120 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	PLP1	Q04004	230 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	ANT1	Q06497	328 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	PAU20	Q08322	120 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YOP1	Q12402	180 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	PAU9	Q3E770	120 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	SCS22	Q6Q595	175 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YAL065C	O13511	128 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	HMRA2	P0CY13	119 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	SHU1	P38751	150 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	SRP14	P38985	146 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	0.63	□□□□□ -2.31	RIP-Chip
TTI1	YKL033W	CYB5	P40312	120 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YJL144W	P47009	104 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	SNN1	P48232	102 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	OST3	P48439	350 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YLR118C	Q12354	227 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	ENV10	Q99382	181 aa		0.63	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	0.62	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		0.62	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	PAU19	P0CE85	124 aa		0.62	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	PAU21	P0CE86	164 aa		0.62	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	PAU22	P0CE87	164 aa		0.62	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	PAU3	P25610	124 aa		0.62	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	SCM4	P32564	187 aa		0.62	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YPL073C	P40323	161 aa		0.62	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	PAU15	P40585	124 aa		0.62	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YCL001W-A	P87012	153 aa		0.62	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		0.62	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YHR007C-A	Q07074	71 aa		0.62	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		0.62	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	BSC4	P53841	131 aa		0.62	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	DDR2	P89113	61 aa		0.62	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YDR042C	Q03205	200 aa		0.62	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		0.62	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	SHG1	P38337	142 aa		0.62	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	GPI19	Q04082	140 aa		0.62	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	COX19	Q3E731	98 aa		0.62	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		0.61	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	UGX2	P32772	223 aa		0.61	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	TOA2	P32774	122 aa		0.61	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YBR292C	P38357	123 aa		0.61	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	MVB12	P42939	101 aa		0.61	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	ABF2	Q02486	183 aa		0.61	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		0.61	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	PAU16	P35994	123 aa		0.61	□□□□□ -2.31

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.2 ms