RNA–Protein interactions for RNA: YHR076W

PTC7, Transcript of Type 2C serine/threonine protein phosphatase (PP2C), yeast

Gene PTC7, Length 1,032 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PTC7	YHR076W	DCV1	P43595	202 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTC7	YHR076W	MRPL44	P19956	98 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTC7	YHR076W	APS1	P35181	156 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTC7	YHR076W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PTC7	YHR076W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTC7	YHR076W	DYN1	P36022	4092 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PTC7	YHR076W	YCR007C	P25354	239 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PTC7	YHR076W	VAM10	Q08474	114 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PTC7	YHR076W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PTC7	YHR076W	ATP5	P09457	212 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	SCM4	P32564	187 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	YNL217W	P40152	326 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	HAC1	P41546	238 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	PMP3	P87284	55 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	SGF11	Q03067	99 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	DGA1	Q08650	418 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	YGL230C	P53074	147 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	HMRA2	P0CY13	119 aa		5	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	SEC11	P15367	167 aa		5	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	YCR001W	P25347	104 aa		5	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	MRP49	P32388	137 aa		5	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	KRE9	P39005	276 aa		5	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	YMR103C	Q04436	120 aa		5	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	TRP1	P00912	224 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	UBC5	P15732	148 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	YKL044W	P36092	106 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	SAE3	P89114	91 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	NRG2	P38082	220 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	YJR146W	P47174	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	BET5	Q03630	159 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	NAT5	Q08689	176 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	YKL070W	P36087	169 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	SCW10	Q04951	389 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTC7	YHR076W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	YAR029W	P39549	74 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
PTC7	YHR076W	HAL1	Q01766	294 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	PAU23	Q07987	124 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	PAU17	Q12370	124 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	AIM29	P36154	155 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	YBR209W	P38311	105 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	YIL059C	P40520	121 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	PPT2	Q12036	173 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	AUA1	P32450	94 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	GLC8	P41818	229 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	SPC1	P46965	94 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	CWC27	Q02770	301 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	YPL261C	Q08976	102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	YEL008W	P40001	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	YPL073C	P40323	161 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	STF1	P01098	86 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	ATP15	P21306	62 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	PEX17	P40155	199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	YGL088W	P53151	121 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	AIM11	P87275	137 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	YML079W	Q03629	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTC7	YHR076W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
PTC7	YHR076W	ERG28	P40030	148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTC7	YHR076W	YLR194C	Q05777	254 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTC7	YHR076W	HAP3	P13434	144 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTC7	YHR076W	YKR041W	P36134	250 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTC7	YHR076W	ENV10	Q99382	181 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTC7	YHR076W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTC7	YHR076W	SHU1	P38751	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTC7	YHR076W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTC7	YHR076W	EOS1	P53938	366 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTC7	YHR076W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTC7	YHR076W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTC7	YHR076W	QCR8	P08525	94 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTC7	YHR076W	YER085C	P40058	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTC7	YHR076W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTC7	YHR076W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTC7	YHR076W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTC7	YHR076W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTC7	YHR076W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTC7	YHR076W	RTC6	O14464	93 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTC7	YHR076W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTC7	YHR076W	RPR2	P40571	144 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTC7	YHR076W	ELC1	Q03071	99 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTC7	YHR076W	YMR295C	Q03559	197 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTC7	YHR076W	YMR320W	Q04897	101 aa		4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 44.2 ms