RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeastyeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP4YHR069C PMP3P87284 55 aa4.07□□□□□ -1.76
RRP4YHR069C YDR042CQ03205 200 aa4.07□□□□□ -1.76
RRP4YHR069C MRP49P32388 137 aa4.06□□□□□ -1.76
RRP4YHR069C POP3P53833 195 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RRP4YHR069C DPP1Q05521 289 aa4.06□□□□□ -1.76
RRP4YHR069C YLR112WQ12130 139 aa4.06□□□□□ -1.76
RRP4YHR069C YMR122W-AQ3E842 84 aa4.06□□□□□ -1.76
RRP4YHR069C YIL134C-AQ45U18 67 aa4.06□□□□□ -1.76
RRP4YHR069C YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa4.06□□□□□ -1.76
RRP4YHR069C COA3Q3E7B2 85 aa4.05□□□□□ -1.76
RRP4YHR069C PAU16P35994 123 aa4.04□□□□□ -1.76
RRP4YHR069C ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data4.04□□□□□ -1.76not detected
RRP4YHR069C YGL088WP53151 121 aa4.04□□□□□ -1.76
RRP4YHR069C YOR008C-AQ3E7B9 74 aa4.04□□□□□ -1.76
RRP4YHR069C TRP1P00912 224 aa4.03□□□□□ -1.76
RRP4YHR069C RPL33AP05744 107 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RRP4YHR069C HMRA2P0CY13 119 aa4.03□□□□□ -1.76
RRP4YHR069C RPL33BP41056 107 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RRP4YHR069C SPC1P46965 94 aa4.03□□□□□ -1.76
RRP4YHR069C HTL1Q9URQ5 78 aa4.03□□□□□ -1.76
RRP4YHR069C RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C YBR209WP38311 105 aa4.02□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C FYV4P38783 130 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C YEL008WP40001 126 aa4.02□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C ERV14P53173 138 aa4.02□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C ERI1P62651 68 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C TPT1Q12272 230 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C COA6Q3E846 104 aa4.02□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C ADH2P00331 348 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C AIM29P36154 155 aa4.01□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C YIL059CP40520 121 aa4.01□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C PKR1Q03880 122 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C YMR103CQ04436 120 aa4.01□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C YDR115WQ04598 105 aa4.01□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C PBA1Q05778 276 aa4.01□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C YDL022C-AP0C5L6 82 aa4□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C YKL070WP36087 169 aa4□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C YBR219CP38317 127 aa4□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C YMR320WQ04897 101 aa4□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C SEC11P15367 167 aa3.99□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C YER085CP40058 173 aa3.99□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C CNL1Q06333 122 aa3.99□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C SCS22Q6Q595 175 aa3.99□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C RTC6O14464 93 aa3.98□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C ATP15P21306 62 aa3.98□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C APS1P35181 156 aa3.98□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C ERG28P40030 148 aa3.98□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C HAC1P41546 238 aa3.98□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C YLR194CQ05777 254 aa3.98□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C YPR195CQ06594 109 aa3.98□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C RRT15Q3E811 62 aa3.98□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C YCL021W-AQ96VH3 125 aa3.98□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C YGL230CP53074 147 aa3.97□□□□□ -1.77
RRP4YHR069C YPR010C-AA5Z2X5 72 aa3.96□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C YBL081WP38180 368 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C AIM11P87275 137 aa3.96□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C YMR295CQ03559 197 aa3.96□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C BET5Q03630 159 aa3.96□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C YDL157CQ12082 118 aa3.96□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C DFM1Q12743 341 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C FUN14P18411 198 aa3.95□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C SVP26P38869 228 aa3.95□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C YEL067CP39978 195 aa3.95□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C MRPL44P19956 98 aa3.94□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C YAR029WP39549 74 aa3.94□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C RPC10P40422 70 aa3.94□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C LSM8P47093 109 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C YPL261CQ08976 102 aa3.94□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C ENV10Q99382 181 aa3.94□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C SCM4P32564 187 aa3.93□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C YKL044WP36092 106 aa3.93□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C YKR041WP36134 250 aa3.93□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C MSL1P40567 111 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C MRPS12P53732 153 aa3.93□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C NAT5Q08689 176 aa3.93□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C FYV7Q12247 151 aa3.93□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C YAL065CO13511 128 aa3.92□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C SHU1P38751 150 aa3.92□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C YAL064WP39711 94 aa3.92□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C YNR077CP53758 84 aa3.92□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C RPL32P38061 130 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C COX14P39103 70 aa3.91□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data3.91□□□□□ -1.78not detected
RRP4YHR069C CIN5P40917 295 aa3.91□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C YMR175W-AQ3E766 64 aa3.91□□□□□ -1.78
RRP4YHR069C YCR007CP25354 239 aa3.9□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C PEX17P40155 199 aa3.9□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C YPL073CP40323 161 aa3.9□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C YAR023CD6VPM8 179 aa3.89□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C ANB1P19211 157 aa3.89□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C CGR1P53188 120 aa3.89□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C YPL229WQ99395 206 aa3.89□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C ATP5P09457 212 aa3.88□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C TOA2P32774 122 aa3.88□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C GAT4P40569 121 aa3.88□□□□□ -1.79
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