RNA–Protein interactions for RNA: YFR027W

ECO1, Transcript of Acetyltransferase, yeast

Gene ECO1, Length 846 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECO1	YFR027W	SPI1	P40092	148 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ECO1	YFR027W	GAT4	P40569	121 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ECO1	YFR027W	RPR2	P40571	144 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ECO1	YFR027W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.66	□□□□□ -1.98	not detected
ECO1	YFR027W	YOR387C	Q08910	206 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ECO1	YFR027W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
ECO1	YFR027W	YPL261C	Q08976	102 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ECO1	YFR027W	SPO24	Q3E752	67 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ECO1	YFR027W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	SWD3	P38123	315 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	MTC6	P38849	526 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YEL067C	P39978	195 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	PIR5	P46999	287 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	FIT2	Q08906	153 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YDL009C	Q12210	107 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	TIM22	Q12328	207 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YHR213W	P0CI67	198 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	LDB16	P25587	256 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	MPC2	P38857	129 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	PET8	P38921	284 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	PGU1	P47180	361 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	TOS6	P48560	102 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	SWS2	P53937	143 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	CCW14	O13547	238 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	SPS100	P13130	326 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	MSA2	P36157	363 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	DCV1	P43595	202 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	2.63	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YMR321C	Q04898	105 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YLR194C	Q05777	254 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	PBA1	Q05778	276 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	MIC10	Q96VH5	97 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	AGA1	P32323	725 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YHR022C	P38763	256 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	RSM18	P40033	138 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YFL019C	P43576	117 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	ECO1	P43605	281 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	EAF6	P47128	113 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	NRM1	P53718	249 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YMR181C	Q03231	154 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YMR295C	Q03559	197 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YOR343C	Q12484	108 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	COA3	Q3E7B2	85 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	CCH1	P50077	2039 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YAL065C	O13511	128 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	MDM35	O60200	86 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	HMRA2	P0CY13	119 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YCR022C	P25620	114 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YKR032W	P36127	104 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YKR045C	P36138	183 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	VHS2	P40463	436 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	KEG1	P43614	200 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	TOM7	P53507	60 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	ICY1	Q04329	127 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	IRC19	Q07843	230 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YOL118C	Q08259	102 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YOR314W	Q12506	109 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	TSC3	Q3E790	80 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	MXR2	P25566	168 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	RPB9	P27999	122 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YHL005C	P38752	130 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	2.6	□□□□□ -1.99	not detected
ECO1	YFR027W	HUR1	P45820	110 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	ICS3	P47034	131 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	SPG1	P50088	95 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YGL193C	P53097	103 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	DAD4	P69851	72 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	RRT15	Q3E811	62 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	MIG3	P39943	394 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	NCE101	Q02820	53 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YHP1	Q04116	353 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YDR182W-A	Q3E796	67 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ECO1	YFR027W	YAL064W-B	O13512	126 aa		2.58	□□□□□ -2
ECO1	YFR027W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ECO1	YFR027W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ECO1	YFR027W	YIL029C	P40538	142 aa		2.58	□□□□□ -2
ECO1	YFR027W	YFR035C	P43608	114 aa		2.58	□□□□□ -2
ECO1	YFR027W	YDR274C	P87283	123 aa		2.58	□□□□□ -2
ECO1	YFR027W	API2	Q04413	109 aa		2.58	□□□□□ -2
ECO1	YFR027W	YLR162W	Q06235	118 aa		2.58	□□□□□ -2
ECO1	YFR027W	ATP20	Q12233	115 aa		2.58	□□□□□ -2
ECO1	YFR027W	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		2.58	□□□□□ -2
ECO1	YFR027W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		2.58	□□□□□ -2
ECO1	YFR027W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 103.1 ms