RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	YLR415C	O13578	112 aa		2.26	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	VRP1	P37370	817 aa		2.26	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		2.26	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YCR006C	P25350	157 aa		2.25	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	SED1	Q01589	338 aa		2.25	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	CTR2	P38865	189 aa		2.25	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YCH1	P42937	148 aa		2.25	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		2.25	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	ESP1	Q03018	1630 aa		2.25	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YAL064W	P39711	94 aa		2.25	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	2.25	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	2.25	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YCR001W	P25347	104 aa		2.25	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		2.25	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	IMP2	P46972	177 aa		2.25	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YPS5	P53057	165 aa		2.25	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		2.25	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YLR358C	O13565	187 aa		2.25	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YKL097C	P34245	136 aa		2.24	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	SAP30	P38429	201 aa		2.24	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.24	□□□□□ -2.05	not detected
TOM1	YDR457W	YBR201C-A	Q2V2Q3	67 aa		2.24	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	MVB12	P42939	101 aa		2.24	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YOL118C	Q08259	102 aa		2.24	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	SPS100	P13130	326 aa		2.24	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	TOS6	P48560	102 aa		2.24	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YIL086C	P40503	102 aa		2.24	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	2.24	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YBR090C	P38253	122 aa		2.23	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	AGA1	P32323	725 aa		2.23	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YEL068C	P39977	110 aa		2.23	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YER084W	P40057	128 aa		2.23	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	ICY1	Q04329	127 aa		2.23	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		2.23	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	MXR2	P25566	168 aa		2.23	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YIL156W-B	Q2V2P4	73 aa		2.23	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		2.23	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		2.23	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	2.23	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	API2	Q04413	109 aa		2.23	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		2.23	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YNR014W	P53719	212 aa		2.23	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	TIM17	P39515	158 aa		2.22	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YER187W	P40102	141 aa		2.22	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		2.22	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		2.22	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	ICS3	P47034	131 aa		2.22	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	BSC4	P53841	131 aa		2.22	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YJL133C-A	Q3E7A3	74 aa		2.22	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	GCN2	P15442	1659 aa		2.22	□□□□□ -2.05
TOM1	YDR457W	YHL005C	P38752	130 aa		2.21	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	RTC6	O14464	93 aa		2.21	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		2.21	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YFR035C	P43608	114 aa		2.21	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	USV1	Q12132	391 aa		2.21	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	HOT13	P36078	116 aa		2.21	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YEL014C	P39999	101 aa		2.21	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YEL008W	P40001	126 aa		2.21	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	RPR2	P40571	144 aa		2.21	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YEL067C	P39978	195 aa		2.21	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	ECM19	Q06011	112 aa		2.2	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YHR007C-A	Q07074	71 aa		2.2	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		2.2	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YBR219C	P38317	127 aa		2.2	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YCR022C	P25620	114 aa		2.2	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	FLO9	P39712	1322 aa		2.2	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YNL190W	P53872	204 aa		2.2	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YML122C	Q03207	126 aa		2.2	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	MMS2	P53152	137 aa		2.2	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YGL015C	P33199	130 aa		2.2	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YJR146W	P47174	117 aa		2.2	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	RPB9	P27999	122 aa		2.19	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		2.19	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	PET8	P38921	284 aa		2.19	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	KRE9	P39005	276 aa		2.19	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YGR025W	P53216	100 aa		2.19	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YBL044W	P38194	122 aa		2.19	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		2.19	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	SHH4	Q06236	168 aa		2.18	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	LIP1	Q03579	150 aa		2.18	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	2.18	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	SNF2	P22082	1703 aa		2.18	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	VMA3	P25515	160 aa		2.18	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YPL080C	Q02826	108 aa		2.18	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YKR032W	P36127	104 aa		2.18	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		2.18	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		2.18	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YKL102C	P34249	101 aa		2.17	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		2.17	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YDR010C	Q12426	110 aa		2.17	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	RGM1	Q00453	211 aa		2.17	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YOL160W	Q08321	113 aa		2.17	□□□□□ -2.06

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