RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W PDR10P51533 1564 aa0.69□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W YRF1-6P53819 1859 aa0.69□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W URA2P07259 2214 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W YIR020CP40575 100 aa0.68□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W YOS1Q3E834 85 aa0.68□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W SWR1Q05471 1514 aa0.68□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W SSN2P38931 1420 aa0.67□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W PAU19P0CE85 124 aa0.67□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W UBC4P15731 148 aa0.67□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W PAU3P25610 124 aa0.67□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W SRB6P32570 121 aa0.67□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W PAU2P32612 120 aa0.67□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W PAU24P38155 120 aa0.67□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W MIX14Q04341 121 aa0.67□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W RSF2P46974 1380 aa0.67□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W BPT1P14772 1559 aa0.66□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W HMRA2P0CY13 119 aa0.66□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W EMC5P40540 141 aa0.66□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W MSL1P40567 111 aaPredicted RBP0.66□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W VPS55P47111 140 aa0.66□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W RSM19P53733 91 aaPredicted RBP0.66□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W KSH1Q8TGJ3 72 aa0.66□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W MIC10Q96VH5 97 aa0.66□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W NUM1Q00402 2748 aa0.66□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W NTE1Q04958 1679 aa0.65□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W URB1P34241 1764 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.3
NSE4YDL105W BNI1P41832 1953 aa0.65□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W PAU16P35994 123 aa0.65□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W PAU15P40585 124 aa0.65□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W LSM6Q06406 86 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W YDR029WQ12111 104 aa0.65□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa0.65□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W YCR075W-AQ3E830 75 aa0.65□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W SEC16P48415 2195 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W LTE1P07866 1435 aa0.64□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W SEC7P11075 2009 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W YOL118CQ08259 102 aa0.64□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W SUS1Q6WNK7 96 aa0.64□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W MYO1P08964 1928 aa0.64□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W DNF1P32660 1571 aa0.63□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W IRC20Q06554 1556 aa0.63□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W ECM12O13529 151 aa0.63□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W ROX3P25046 220 aa0.63□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W YHL005CP38752 130 aa0.63□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W SNU13P39990 126 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W IMP2P46972 177 aa0.63□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W MRPS12P53732 153 aa0.63□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W NHP10Q03435 203 aa0.63□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W YGL194C-AQ2V2P6 80 aa0.63□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W YCR095W-AQ3E787 52 aa0.63□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W GDB1Q06625 1536 aa0.63□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W HMRA1P0CY11 126 aa0.62□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W GCV3P39726 170 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W RSM18P40033 138 aa0.62□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W PAU5P43575 122 aa0.62□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W SNA2P56508 79 aa0.62□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W RRT15Q3E811 62 aa0.62□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W MHF2Q3E829 80 aa0.62□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W ESP1Q03018 1630 aa0.62□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W YRF1-1P0CX20 1796 aa0.62□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W YRF1-5P0CX21 1796 aa0.62□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W YRF1-8P0CX22 1796 aa0.62□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W MMS1Q06211 1407 aa0.62□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W YOR093CQ12275 1648 aa0.61□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W AUA1P32450 94 aa0.61□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W MRX7P53869 86 aa0.61□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W SCP1Q08873 200 aa0.61□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W YPL038W-AQ3E7B4 63 aa0.61□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W YRF1-2P40105 1681 aa0.61□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W SRB8P25648 1427 aa0.61□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W TY4B-HP0C2J7 1802 aa0.61□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W POL1P13382 1468 aa0.61□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W SIN3P22579 1536 aa0.6□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W CCW14O13547 238 aa0.6□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W MRP17P28778 131 aa0.6□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W YBL071CP38185 102 aa0.6□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W BLM10P43583 2143 aa0.6□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W COX12Q01519 83 aa0.6□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W YDR042CQ03205 200 aa0.6□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W YMR082CQ04276 118 aa0.6□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W YDR010CQ12426 110 aa0.6□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W YSP2Q06681 1438 aa0.6□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa0.6□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W PAU6P0CE90 120 aa0.59□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W PAU18P0CE91 120 aa0.59□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W AIM19P40502 157 aa0.59□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W YIL086CP40503 102 aa0.59□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W SPC1P46965 94 aa0.59□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W YDR210WQ03482 75 aa0.59□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W ICY1Q04329 127 aa0.59□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W YBR072C-AQ3E794 53 aa0.59□□□□□ -2.31
NSE4YDL105W MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W CDC25P04821 1589 aa0.58□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W HIR3P47171 1648 aa0.58□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W DNF2Q12675 1612 aa0.58□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W BRR2P32639 2163 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
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