RNA–Protein interactions for RNA: YBL011W

SCT1, Transcript of Glycerol 3-phosphate/dihydroxyacetone phosphate sn-1 acyltransferase, yeast

Gene SCT1, Length 2,280 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCT1	YBL011W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	YGR269W	P40326	108 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	SHH4	Q06236	168 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	USV1	Q12132	391 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	EMC6	Q12431	108 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	Q0255	P03881	472 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	MIC10	Q96VH5	97 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	QRI5	P32344	111 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	FPR2	P32472	135 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	YNL046W	P53956	172 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	HAL1	Q01766	294 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	MRPL39	P36533	70 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	SFT2	P38166	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	CSH1	P38287	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	YFL019C	P43576	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	YMR007W	Q03675	126 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	HFA1	P32874	2273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	APS1	P35181	156 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	MTC6	P38849	526 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	YER084W	P40057	128 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	YNL234W	P53857	426 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	LST8	P41318	303 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	YPL261C	Q08976	102 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	ROX3	P25046	220 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	YER187W	P40102	141 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	PIR5	P46999	287 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	TOS8	P53147	276 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	YGL034C	P53186	121 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	YOR268C	Q08734	132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	RPB10	P22139	70 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	RNH203	Q12338	110 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	YPI1	P43587	155 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	SIP18	P50263	79 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	YDR114C	Q04597	100 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	YEL067C	P39978	195 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	PEX17	P40155	199 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	SIM1	P40472	476 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	UBC13	P52490	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	YNL217W	P40152	326 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	KEG1	P43614	200 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	LDB16	P25587	256 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	YFL051C	P43552	160 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	IRC23	Q08416	157 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SCT1	YBL011W	YSY6	P38374	65 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	YIA6	P40556	373 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	YHP1	Q04116	353 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	ICY1	Q04329	127 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	YBR209W	P38311	105 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	YNR077C	P53758	84 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	MEC1	P38111	2368 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	YFR035C	P43608	114 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	ICS3	P47034	131 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	PFY1	P07274	126 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	SPS100	P13130	326 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	HUA1	P40325	198 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	YMR295C	Q03559	197 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	PET8	P38921	284 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	TSC3	Q3E790	80 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	RPL39	P04650	51 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	RPB9	P27999	122 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	YHR173C	P38864	112 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	YFL015C	P43578	164 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	PBA1	Q05778	276 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.47	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	YKR045C	P36138	183 aa		4.47	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	ATP19	P81451	68 aa		4.47	□□□□□ -1.69
SCT1	YBL011W	PPT2	Q12036	173 aa		4.47	□□□□□ -1.69

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