RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635997.1

NEDD4L-238, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5 BASIC

Gene NEDD4L, Length 4,402 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-238	ENST00000635997	EPHB3	P54753	998 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	STX1B	P61266	288 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	PPP3CA	Q08209	521 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	LONRF1	Q17RB8	773 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	NUF2	Q9BZD4	464 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	MUC3B	Q9H195	1237 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	INTU	Q9ULD6	942 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	LACTBL1	A8MY62	500 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	NDST1	P52848	882 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	SPARCL1	Q14515	664 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	KLC3	Q6P597	504 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	ADAM32	Q8TC27	787 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	TCHH	Q07283	1943 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997		E5RI56	91 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997		H3BQF6	201 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	NFKBIA	P25963	317 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	WEE1	P30291	646 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	PNPLA4	P41247	253 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	ERF	P50548	548 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	RAD51	Q06609	339 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	DNAJC7	Q99615	494 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	APOL2	Q9BQE5	337 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	CLDND1	Q9NY35	253 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	LTN1	O94822	1766 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	CYP3A4	P08684	503 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	TM4SF4	P48230	202 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	TMC2	Q8TDI7	906 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	MTMR8	Q96EF0	704 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	SPTLC1	O15269	473 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	ODC1	P11926	461 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	GLRA2	P23416	452 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	WDCP	Q9H6R7	721 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	WBP1L	Q9NX94	342 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	RECQL4	O94761	1208 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	CXCL14	O95715	111 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	SPATA17	Q96L03	361 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	C12orf42	Q96LP6	360 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	FUT8	Q9BYC5	575 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	SASH3	O75995	380 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	IL1RL1	Q01638	556 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	GGT7	Q9UJ14	662 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	GUCY1A3	Q02108	690 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	EFEMP1	Q12805	493 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	DRP2	Q13474	957 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	USP38	Q8NB14	1042 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	FBXO32	Q969P5	355 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	FGD4	Q96M96	766 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	KRT82	Q9NSB4	513 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	B4GALT5	O43286	388 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	PHF2	O75151	1096 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	VDR	P11473	427 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02

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