RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 DLATP10515 647 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 CYP2J2P51589 502 aa23.56■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 AMPD2Q01433 879 aa23.56■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 RUNX3Q13761 415 aa23.56■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 RNF43Q68DV7 783 aa23.56■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 TXNDC8Q6A555 127 aa23.56■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 C4orf50Q6ZRC1 276 aa23.56■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 CEP295NLQ96MC4 621 aa23.56■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 CRTAC1Q9NQ79 661 aa23.56■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 HPS4Q9NQG7 708 aa23.56■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 MYO16Q9Y6X6 1858 aa23.56■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 KLRC4O43908 158 aa23.55■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 STAU1O95793 577 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 PROS1P07225 676 aa23.55■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 SLFN14P0C7P3 912 aa23.55■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 LMO2P25791 158 aa23.55■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 AFMP43652 599 aa23.55■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 ELF2Q15723 593 aa23.55■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 PLK5Q496M5 336 aa23.55■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 VSTM1Q6UX27 236 aa23.55■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 RDH13Q8NBN7 331 aa23.55■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 RIN3Q8TB24 985 aa23.55■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 MYLPFQ96A32 169 aa23.55■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 FNBP1Q96RU3 617 aa23.55■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 SMOC1Q9H4F8 434 aa23.55■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 SLC39A2Q9NP94 309 aa23.55■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 GKN1Q9NS71 199 aa23.55■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 TDP1Q9NUW8 608 aa23.55■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 FAM208BQ5VWN6 2430 aa23.54■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 RNF40O75150 1001 aa23.54■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 ATP2C2O75185 946 aa23.54■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 TACC1O75410 805 aa23.54■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 FAM163BP0C2L3 166 aa23.54■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 TNNI1P19237 187 aa23.54■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa23.54■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa23.54■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 CEP57L1Q8IYX8 460 aa23.54■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 TMEM174Q8WUU8 243 aa23.54■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 EXOC4Q96A65 974 aa23.54■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 CHFRQ96EP1 664 aa23.54■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 SPATA17Q96L03 361 aa23.54■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 EDEM2Q9BV94 578 aa23.54■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 NME7Q9Y5B8 376 aa23.54■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 ATG2BQ96BY7 2078 aa23.54■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 CST3P01034 146 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 DRD1P21728 446 aa23.53■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 FBXO43Q4G163 708 aa23.53■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 KIAA0895Q8NCT3 520 aa23.53■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 GOLGA5Q8TBA6 731 aa23.53■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 CCDC127Q96BQ5 260 aa23.53■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 HHIPQ96QV1 700 aa23.53■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 EBF3Q9H4W6 596 aa23.53■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 SERTAD1Q9UHV2 236 aa23.53■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 NUP205Q92621 2012 aa23.52■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 EGFP01133 1207 aa23.52■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 FAM160A1Q05DH4 1040 aa23.52■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 USP4Q13107 963 aa23.52■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 TRIM68Q6AZZ1 485 aa23.52■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 TCEAL6Q6IPX3 200 aa23.52■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 SCN4BQ8IWT1 228 aa23.52■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa23.52■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 ZNF516Q92618 1163 aa23.52■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 TCEAL3Q969E4 200 aa23.52■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 PCED1BQ96HM7 432 aa23.52■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 MMS19Q96T76 1030 aa23.52■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 XYLT2Q9H1B5 865 aa23.52■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 VRTNQ9H8Y1 702 aa23.52■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 RHOBTB1O94844 696 aa23.51■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 CMA1P23946 247 aa23.51■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 CLDN10P78369 228 aa23.51■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 ZNF77Q15935 545 aa23.51■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa23.51■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 SLC9A9Q8IVB4 645 aa23.51■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 PLEKHO2Q8TD55 490 aa23.51■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 ACDQ96AP0 544 aa23.51■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 PAGE5Q96GU1 130 aa23.51■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 TTLL2Q9BWV7 592 aa23.51■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 GCNT4Q9P109 453 aa23.51■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 USP25Q9UHP3 1055 aa23.51■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 HPSEQ9Y251 543 aa23.51■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa23.5■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 EXOC3O60645 756 aa23.5■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 APBB3O95704 486 aa23.5■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 MYL1P05976 194 aa23.5■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 TCF3P15923 654 aa23.5■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 PFKFB1P16118 471 aa23.5■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 BDNFP23560 247 aa23.5■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 ATICP31939 592 aa23.5■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 STK4Q13043 487 aa23.5■■□□□ 1.35
SRRT-218ENST00000620394 MTF1Q14872 753 aa23.5■■□□□ 1.35
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