RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF516	Q92618	1163 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	NACA2	Q9H009	215 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	EBF3	Q9H4W6	596 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	SCN1A	P35498	2009 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	TSC2	P49815	1807 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	NCAN	O14594	1321 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRIO	O75962	3097 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	CETN3	O15182	167 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	NFATC1	O95644	943 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	CDH8	P55286	799 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	ENPEP	Q07075	957 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	STIM1	Q13586	685 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	NFIL3	Q16649	462 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZACN	Q401N2	412 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	TSSK4	Q6SA08	328 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	SV2A	Q7L0J3	742 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	UNC93A	Q86WB7	457 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	NUP93	Q8N1F7	819 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	FBXO32	Q969P5	355 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCL26	Q9Y258	94 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	ANK1	P16157	1881 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	HLA-DRA	P01903	254 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	DRD1	P21728	446 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	CNR2	P34972	360 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	RAP1GAP	P47736	663 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	DLG4	P78352	724 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	TAF10	Q12962	218 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	FBXO43	Q4G163	708 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACOT1	Q86TX2	421 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM35A	Q86V20	835 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	TTC39C	Q8N584	583 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	SMARCE1	Q969G3	411 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	KRT82	Q9NSB4	513 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	COMMD8	Q9NX08	183 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	TCHH	Q07283	1943 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	C2orf78	A6NCI8	922 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	SHISA7	A6NL88	538 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	CLDN5	O00501	218 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	TADA3	O75528	432 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	AP1G2	O75843	785 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	AKAP3	O75969	853 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	ARSA	P15289	507 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	GTF2H1	P32780	548 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	PPP1R2	P41236	205 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	GCLM	P48507	274 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	NDST1	P52848	882 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	SATB1	Q01826	763 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	USP4	Q13107	963 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	FZD5	Q13467	585 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF77	Q15935	545 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	WDR44	Q5JSH3	913 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	CEP68	Q76N32	757 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	CD101	Q93033	1021 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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