RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 CACNA2D1P54289 1103 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-214ENST00000601319 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
HERC3-214ENST00000601319 TPRG1Q6ZUI0 275 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-214ENST00000601319 PAQR9Q6ZVX9 377 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-214ENST00000601319 FRMD5Q7Z6J6 570 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-214ENST00000601319 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-214ENST00000601319 YAF2Q8IY57 180 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-214ENST00000601319 FUKQ8N0W3 1084 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-214ENST00000601319 TTC39CQ8N584 583 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-214ENST00000601319 MAB21L3Q8N8X9 362 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-214ENST00000601319 BPIFB1Q8TDL5 484 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-214ENST00000601319 NELFBQ8WX92 580 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-214ENST00000601319 SEMA4DQ92854 862 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-214ENST00000601319 LRRC3BQ96PB8 259 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-214ENST00000601319 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
HERC3-214ENST00000601319 HEBP1Q9NRV9 189 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-214ENST00000601319 RAB20Q9NX57 234 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-214ENST00000601319 KIAA1468Q9P260 1216 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-214ENST00000601319 SIT1Q9Y3P8 196 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-214ENST00000601319 BIN1O00499 593 aa18.26■□□□□ 0.51
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HERC3-214ENST00000601319 STK25O00506 426 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 CILPO75339 1184 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 PPP3CCP48454 512 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 PDE6CP51160 858 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 USP46P62068 366 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 PLCB2Q00722 1185 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 CBWD6Q4V339 395 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 CBWD3Q5JTY5 395 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 CBWD5Q5RIA9 395 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 TCERG1LQ5VWI1 586 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 TXNDC8Q6A555 127 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 KLHL10Q6JEL2 608 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 C1orf228Q6PIY5 440 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 ACOT1Q86TX2 421 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 DTWD2Q8NBA8 298 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 NELL2Q99435 816 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 FOXQ1Q9C009 403 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 DNAI2Q9GZS0 605 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 LTB4R2Q9NPC1 389 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 TDP1Q9NUW8 608 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 CTNND2Q9UQB3 1225 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 SHISA7A6NL88 538 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 MAN2B1O00754 1011 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 PMM2O15305 246 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 MAGEA9P43362 315 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 PAK1Q13153 545 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 ZNF852Q6ZMS4 543 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 OVCA2Q8WZ82 227 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 NT5C1AQ9BXI3 368 aa18.25■□□□□ 0.51
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HERC3-214ENST00000601319 KRT82Q9NSB4 513 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 LRRN2O75325 713 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 USP17L7P0C7H9 530 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 TCF3P15923 654 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 MARSP56192 900 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 NUP93Q8N1F7 819 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 PDZD8Q8NEN9 1154 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 SLC2A14Q8TDB8 520 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 SLITRK1Q96PX8 696 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 TWNKQ96RR1 684 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 MED10Q9BTT4 135 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP18.24■□□□□ 0.513e-34■■■■■ 819.8
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HERC3-214ENST00000601319 IL37Q9NZH6 218 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 GCNT4Q9P109 453 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 CCL26Q9Y258 94 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 PIAS3Q9Y6X2 628 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 FAM92AA1XBS5 289 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 ZNF840PA6NDX5 716 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 TNFRSF10BO14763 440 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 AP1G2O75843 785 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 GNA14O95837 355 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 OLFM2O95897 454 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 CKMP06732 381 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 CCDC130P13994 396 aa18.23■□□□□ 0.51
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HERC3-214ENST00000601319 USP4Q13107 963 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 ORC1Q13415 861 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 UBXN2BQ14CS0 331 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 CCDC40Q4G0X9 1142 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 WDR44Q5JSH3 913 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 ZNF687Q8N1G0 1237 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 WHAMMQ8TF30 809 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 CLDN23Q96B33 292 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 KCNK16Q96T55 309 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 CLSTN2Q9H4D0 955 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-214ENST00000601319 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
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