RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592790.1

VMP1-216, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

Gene VMP1, Length 4,325 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-216	ENST00000592790	WASHC5	Q12768	1159 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	TRIP10	Q15642	601 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	CHI3L2	Q15782	390 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	CCDC153	Q494R4	210 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	MTERF2	Q49AM1	385 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	HSPH1	Q92598	858 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	TMX2	Q9Y320	296 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	GPR37	O15354	613 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	AP1G2	O75843	785 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	ASMTL	O95671	621 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	APOC2	P02655	101 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	FAM163B	P0C2L3	166 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	DNAJB2	P25686	324 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	SERPINB3	P29508	390 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	TYK2	P29597	1187 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	ECHS1	P30084	290 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	TTK	P33981	857 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	NAMPT	P43490	491 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	HSPA2	P54652	639 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	EPHB1	P54762	984 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	NCKAP1L	P55160	1127 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	SP4	Q02446	784 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	MAP2K5	Q13163	448 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	LLGL1	Q15334	1064 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	RPS6KA2	Q15349	733 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	STXBP2	Q15833	593 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	ACCSL	Q4AC99	568 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	EFHC2	Q5JST6	749 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	RAPH1	Q70E73	1250 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	SV2A	Q7L0J3	742 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	WDR49	Q8IV35	697 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	NIM1K	Q8IY84	436 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	SPATA18	Q8TC71	538 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	FAM151A	Q8WW52	585 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	SHISA4	Q96DD7	197 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	C7orf26	Q96N11	449 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF302	Q9NR11	478 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	CHST7	Q9NS84	486 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	SEPT3	Q9UH03	358 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	AP4S1	Q9Y587	144 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	MYH10	P35580	1976 aa		3.67	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	COL18A1	P39060	1754 aa		3.67	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		3.67	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		3.67	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	CLPTM1	O96005	669 aa		3.67	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	SERPINE1	P05121	402 aa		3.67	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	SERPINA6	P08185	405 aa		3.67	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	TPBGL	P0DKB5	382 aa		3.67	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	KRT10	P13645	584 aa		3.67	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	GPD1	P21695	349 aa		3.67	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	NPTX2	P47972	431 aa		3.67	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	NOV	P48745	357 aa		3.67	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	HDAC4	P56524	1084 aa		3.67	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	NUP107	P57740	925 aa		3.67	□□□□□ -1.82

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