RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 EDIL3O43854 480 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 PRAMEF1O95521 474 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 PFKMP08237 780 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 ACTN1P12814 892 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 LCP1P13796 627 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC9A1P19634 815 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 PDCP20941 246 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 PTMSP20962 102 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 CD40P25942 277 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC26A2P50443 739 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 ACTR2P61160 394 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIM29Q14134 588 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 Q4G0T1 1027 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 SWSAP1Q6NVH7 229 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 ABHD15Q6UXT9 468 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 OR2C3Q8N628 320 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 AFAP1L1Q8TED9 768 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 HERVK_113Q902F9 699 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 RIT2Q99578 217 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 UMODL1Q5DID0 1318 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 NRCAMQ92823 1304 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 MYO9BQ13459 2157 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 F8W735 103 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 MSH4O15457 936 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 KDM1AO60341 852 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 DTNBO60941 627 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 LARGE1O95461 756 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 CKBP12277 381 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 MTHFD2P13995 350 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 INSRRP14616 1297 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 C5AR1P21730 350 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 ENPP1P22413 925 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 ADAM17P78536 824 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 IRF9Q00978 393 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIM14Q14142 442 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 NPY5RQ15761 445 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM160B1Q5W0V3 765 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 PPP4R3AQ6IN85 833 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 MOXD1Q6UVY6 613 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 DEFB128Q7Z7B8 93 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 SERINC5Q86VE9 423 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 DRC7Q8IY82 874 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 CAMKK1Q8N5S9 505 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 CTAGE1Q96RT6 745 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 PCYT2Q99447 389 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 WNT8AQ9H1J5 351 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 SMOC1Q9H4F8 434 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF302Q9NR11 478 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 NRBP2Q9NSY0 501 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 GJB4Q9NTQ9 266 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 CLEC1BQ9P126 229 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 RSPH10B2B2RC85 870 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 B3GALT2O43825 422 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 HBP1O60381 514 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 JAK2O60674 1132 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 BAG4O95429 457 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 CCNE2O96020 404 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 RSPH10BP0C881 870 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 RPL17P18621 184 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 PAMP19021 973 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 HOXC8P31273 242 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 KRT2P35908 639 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 THPOP40225 353 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 MCM2P49736 904 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 LSAMPQ13449 338 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 PLCB4Q15147 1175 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 GPR19Q15760 415 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 INF2Q27J81 1249 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 LETM2Q2VYF4 491 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 TUBB8Q3ZCM7 444 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF484Q5JVG2 852 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 RNF220Q5VTB9 566 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 KRT40Q6A162 431 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 OTOP2Q7RTS6 562 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms