RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589636.5

BECN1-211, Transcript of beclin 1, humanhuman

TSL 4

Gene BECN1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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BECN1-211ENST00000589636 CYP2S1Q96SQ9 504 aa16.42■□□□□ 0.22
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BECN1-211ENST00000589636 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
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