RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
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CTIF-205ENST00000587860 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 A6NNZ2 444 aa15.8■□□□□ 0.12
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CTIF-205ENST00000587860 KCTD6Q8NC69 237 aa15.77■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 MIS12Q9H081 205 aa15.77■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 PNMA3Q9UL41 463 aa15.77■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 ASAP2O43150 1006 aa15.77■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 STX2P32856 288 aa15.77■□□□□ 0.11
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