RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 RALAP11233 206 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 DESP17661 470 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 TKTP29401 623 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTPN7P35236 360 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 PCK1P35558 622 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 COILP38432 576 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 RXFP2Q8WXD0 754 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 IFT81Q8WYA0 676 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 SEC14L1Q92503 715 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 APBB2Q92870 758 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLITRK1Q96PX8 696 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM161AQ9NX61 479 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 OGFRQ9NZT2 677 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 M0QZQ0 153 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 DPYSL4O14531 572 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 NBNO60934 754 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 SASH3O75995 380 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 PDGFRAP16234 1089 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 CARSP49589 748 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 CASP8Q14790 479 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 MDH1BQ5I0G3 518 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 NOMO2Q5JPE7 1267 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 SCUBE3Q8IX30 993 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 NCAPGQ9BPX3 1015 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 WBP1LQ9NX94 342 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM53CQ9NYF3 392 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 TSC2P49815 1807 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 ESYT3A0FGR9 886 aa30.58■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 GABBR2O75899 941 aa30.58■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 NPR3P17342 541 aa30.58■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa30.58■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 CD300LGQ6UXG3 332 aa30.58■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARCQ7LC44 396 aa30.58■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 SEPT8Q92599 483 aa30.58■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 MED10Q9BTT4 135 aa30.58■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 CRTAC1Q9NQ79 661 aa30.58■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM114A2Q9NRY5 505 aa30.58■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 NNTQ13423 1086 aa30.57■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLLU1OSQ5K130 101 aa30.57■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 KIAA0319Q5VV43 1072 aa30.57■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 NFU1Q9UMS0 254 aa30.57■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTGIRP43119 386 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 PAQR9Q6ZVX9 377 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC26A9Q7LBE3 791 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 JAMLQ86YT9 394 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 DBF4BQ8NFT6 615 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 RSPH1Q8WYR4 309 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 KCTD13Q8WZ19 329 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 CAVIN3Q969G5 261 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 SUSD3Q96L08 255 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 FLT3P36888 993 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 BRCC3P46736 316 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 DSC1Q08554 894 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 TTC27Q6P3X3 843 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 PIGZQ86VD9 579 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC105Q8IYK2 499 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 ACBD6Q9BR61 282 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 ERP44Q9BS26 406 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 VIPAS39Q9H9C1 493 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 ENPP3O14638 875 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 TJP3O95049 919 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 PARNO95453 639 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM200BP0CF97 657 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 LCP1P13796 627 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 TYMPP19971 482 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 MIPP30301 263 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 SDC4P31431 198 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPNMBQ14956 572 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 LLGL1Q15334 1064 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 MFSD7Q6UXD7 560 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLCO2A1Q92959 643 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 HERPUD2Q9BSE4 406 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 HEMGNQ9BXL5 484 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 B3GNT5Q9BYG0 378 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZWILCHQ9H900 591 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 KLHL11Q9NVR0 708 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 USP18Q9UMW8 372 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 GRAP2O75791 330 aa30.54■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 TFDP3Q5H9I0 405 aa30.54■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRNP1Q6NT89 227 aa30.54■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLEC20AQ6ZU45 233 aa30.54■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 DCLK3Q9C098 648 aa30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms