RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571409.1

CTDNEP1-206, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-206ENST00000571409 TNIP3Q96KP6 325 aa32.29■■■□□ 2.76
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CTDNEP1-206ENST00000571409 EHD2Q9NZN4 543 aa32.29■■■□□ 2.76
CTDNEP1-206ENST00000571409 F5P12259 2224 aa32.28■■■□□ 2.76
CTDNEP1-206ENST00000571409 ASS1P00966 412 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
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CTDNEP1-206ENST00000571409 FAM160A1Q05DH4 1040 aa32.28■■■□□ 2.76
CTDNEP1-206ENST00000571409 TRIM68Q6AZZ1 485 aa32.28■■■□□ 2.76
CTDNEP1-206ENST00000571409 SPOPLQ6IQ16 392 aa32.28■■■□□ 2.76
CTDNEP1-206ENST00000571409 TTLL2Q9BWV7 592 aa32.28■■■□□ 2.76
CTDNEP1-206ENST00000571409 SEMA4AQ9H3S1 761 aa32.28■■■□□ 2.76
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CTDNEP1-206ENST00000571409 IER2Q9BTL4 223 aa32.27■■■□□ 2.76
CTDNEP1-206ENST00000571409 MED10Q9BTT4 135 aa32.27■■■□□ 2.76
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CTDNEP1-206ENST00000571409 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP32.27■■■□□ 2.76
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CTDNEP1-206ENST00000571409 LRRC32Q14392 662 aa32.26■■■□□ 2.75
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CTDNEP1-206ENST00000571409 ACOT1Q86TX2 421 aa32.26■■■□□ 2.75
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CTDNEP1-206ENST00000571409 TTC16Q8NEE8 873 aa32.26■■■□□ 2.75
CTDNEP1-206ENST00000571409 GSDMAQ96QA5 445 aa32.26■■■□□ 2.75
CTDNEP1-206ENST00000571409 MMRN2Q9H8L6 949 aa32.26■■■□□ 2.75
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CTDNEP1-206ENST00000571409 PRCPP42785 496 aa32.25■■■□□ 2.75
CTDNEP1-206ENST00000571409 ASPAP45381 313 aa32.25■■■□□ 2.75
CTDNEP1-206ENST00000571409 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
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CTDNEP1-206ENST00000571409 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
CTDNEP1-206ENST00000571409 EEF2KMTQ96G04 330 aa32.25■■■□□ 2.75
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CTDNEP1-206ENST00000571409 ADSSL1Q8N142 457 aa32.23■■■□□ 2.75
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CTDNEP1-206ENST00000571409 SMARCE1Q969G3 411 aa32.23■■■□□ 2.75
CTDNEP1-206ENST00000571409 TIGD1Q96MW7 591 aa32.23■■■□□ 2.75
CTDNEP1-206ENST00000571409 KCNK16Q96T55 309 aa32.23■■■□□ 2.75
CTDNEP1-206ENST00000571409 TMEM8AQ9HCN3 771 aa32.23■■■□□ 2.75
CTDNEP1-206ENST00000571409 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
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CTDNEP1-206ENST00000571409 SLITRK1Q96PX8 696 aa32.22■■■□□ 2.75
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CTDNEP1-206ENST00000571409 CCR3P51677 355 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-206ENST00000571409 FUKQ8N0W3 1084 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-206ENST00000571409 CRYBG2Q8N1P7 616 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-206ENST00000571409 OSCP1Q8WVF1 389 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-206ENST00000571409 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-206ENST00000571409 ZSCAN32Q9NX65 697 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-206ENST00000571409 AP1G2O75843 785 aa32.2■■■□□ 2.75
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