RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569304.1

RAB11A-208, Transcript of RAB11A, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB11A, Length 347 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB11A-208	ENST00000569304	HLA-DOA	P06340	250 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	CSF1R	P07333	972 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	AR	P10275	920 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	NPPB	P16860	134 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	NDUFV1	P49821	464 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	CXADR	P78310	365 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	CYP2A13	Q16696	494 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	RFX8	Q6ZV50	586 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	NACC2	Q96BF6	587 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	ZNF69	Q9UC07	566 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	GAGE12B	A1L429	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	SRGAP2	O75044	1071 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	NPTX2	P47972	431 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	PNLIPRP1	P54315	467 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	POLE2	P56282	527 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	FAM189B	P81408	668 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	E2F2	Q14209	437 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	RALBP1	Q15311	655 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	HS1BP3	Q53T59	392 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	RABL3	Q5HYI8	236 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	VPS53	Q5VIR6	699 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	TBATA	Q96M53	351 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	VPS51	Q9UID3	782 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304		A0A0B4J269	797 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304		F5H697	171 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	PCDH17	O14917	1159 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	DHH	O43323	396 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	RGS10	O43665	173 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	TRIAP1	O43715	76 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	FAM155B	O75949	473 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	ITGA2B	P08514	1039 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	CD53	P19397	219 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	HOXA5	P20719	270 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	CD6	P30203	668 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	PRKAG1	P54619	331 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	BCAT1	P54687	386 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	FPGS	Q05932	587 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	CRHR2	Q13324	411 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	TUBB3	Q13509	450 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	ATP1A4	Q13733	1029 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	CCNI	Q14094	377 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	TAF5	Q15542	800 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	GEN1	Q17RS7	908 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	SPART	Q8N0X7	666 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	SNX19	Q92543	992 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	RSC1A1	Q92681	617 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	ADO	Q96SZ5	270 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAB11A-208	ENST00000569304	GJD2	Q9UKL4	321 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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